39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02130 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02130  hypothetical protein  100 
 
 
589 aa  1205    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0722  hypothetical protein  51.37 
 
 
584 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1536  aerotolerance-related protein BatD  49.16 
 
 
584 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  33.39 
 
 
614 aa  316  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0669  hypothetical protein  28.07 
 
 
659 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  30.56 
 
 
600 aa  222  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2457  hypothetical protein  25.8 
 
 
576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2467  hypothetical protein  24.2 
 
 
452 aa  98.2  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2121  hypothetical protein  23.34 
 
 
436 aa  91.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0274815  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2307  hypothetical protein  26.62 
 
 
443 aa  90.9  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0522074  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1120  hypothetical protein  22.65 
 
 
601 aa  86.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  24.1 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.24 
 
 
611 aa  76.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  21.77 
 
 
585 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  23.37 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2358  hypothetical protein  23.66 
 
 
438 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5073  hypothetical protein  23 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4063  hypothetical protein  21 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000376267  unclonable  0.0000000023713 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1776  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
804 aa  67  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.579513  normal  0.269015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0658  hypothetical protein  24.24 
 
 
486 aa  65.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0525  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.76 
 
 
897 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  23.94 
 
 
549 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  21.62 
 
 
584 aa  61.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  22.47 
 
 
548 aa  60.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  22.7 
 
 
871 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0169  hypothetical protein  24.69 
 
 
667 aa  59.3  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000510437  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  23.44 
 
 
549 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  22.96 
 
 
581 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  21.82 
 
 
595 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  20.78 
 
 
544 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  22.71 
 
 
580 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  22.86 
 
 
546 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  22.72 
 
 
586 aa  48.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  21.63 
 
 
548 aa  47.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2436  hypothetical protein  24.43 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1814  hypothetical protein  24.24 
 
 
446 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  23.47 
 
 
543 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  30.25 
 
 
555 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  21.51 
 
 
546 aa  44.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>