More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0318 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0318  putative AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 555 aa  1126    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00246923  normal  0.308264 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1470  AMP-dependent synthetase and ligase  49.15 
 
 		 530 aa  515  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2266  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 		 545 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  34.25 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.7 
 
 		 544 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.96 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 540 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 549 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 563 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  32.18 
 
 		 547 aa  270  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  33.45 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  31.71 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  31.6 
 
 		 548 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  33.03 
 
 		 552 aa  266  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  32.34 
 
 		 560 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.03 
 
 		 605 aa  263  6.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 543 aa  263  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  31.5 
 
 		 549 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 843 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  32.22 
 
 		 552 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  31.35 
 
 		 568 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  32.84 
 
 		 550 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  30.43 
 
 		 552 aa  250  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 566 aa  250  6e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  30.24 
 
 		 549 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  34.32 
 
 		 564 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 573 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 553 aa  246  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  29.87 
 
 		 549 aa  246  9e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  32.84 
 
 		 557 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  29.87 
 
 		 549 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 564 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  30.93 
 
 		 548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  31.27 
 
 		 574 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 576 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  31.41 
 
 		 549 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  32.66 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  32.46 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 566 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 576 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  35.2 
 
 		 565 aa  242  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  31.22 
 
 		 570 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  31.88 
 
 		 574 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  34.55 
 
 		 538 aa  240  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  31.49 
 
 		 550 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  32.72 
 
 		 576 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2746  putative long chain fatty acid CoA ligase  31.42 
 
 		 543 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 524 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 562 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  31.59 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  32.72 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  32.9 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 		 557 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 566 aa  238  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.78 
 
 		 510 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 538 aa  236  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  31.58 
 
 		 565 aa  236  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  32.28 
 
 		 560 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  32.28 
 
 		 560 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  32.28 
 
 		 560 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 576 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  31.53 
 
 		 570 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  32.94 
 
 		 561 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  31.42 
 
 		 568 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 		 549 aa  233  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  32.09 
 
 		 560 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 558 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  29.03 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 564 aa  233  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 630 aa  230  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 571 aa  230  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.12 
 
 		 828 aa  230  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  32.42 
 
 		 576 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  30.89 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.13 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  32.35 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  32.35 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  31.85 
 
 		 605 aa  227  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  30.06 
 
 		 570 aa  227  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  33.59 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  32.24 
 
 		 540 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 1043 aa  226  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 536 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>