More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2294 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  70.4 
 
 		 464 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  71.16 
 
 		 460 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  72.49 
 
 		 467 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  71.5 
 
 		 452 aa  639    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  87.44 
 
 		 431 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  88.63 
 
 		 433 aa  795    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  88.16 
 
 		 397 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  87.44 
 
 		 431 aa  783    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  86.98 
 
 		 431 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  88.63 
 
 		 433 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  89.79 
 
 		 433 aa  805    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  77.55 
 
 		 432 aa  704    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  100 
 
 		 431 aa  883    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  77.55 
 
 		 432 aa  704    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  71.79 
 
 		 467 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  72.03 
 
 		 465 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  87.44 
 
 		 431 aa  784    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  95.58 
 
 		 431 aa  848    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  86.74 
 
 		 431 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  87.44 
 
 		 431 aa  784    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  90.49 
 
 		 431 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  88.63 
 
 		 431 aa  799    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  71.63 
 
 		 462 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  71.16 
 
 		 459 aa  628  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  72.07 
 
 		 446 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  69.74 
 
 		 455 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  71.16 
 
 		 459 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  67.13 
 
 		 449 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  69.34 
 
 		 448 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  70.1 
 
 		 462 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  66.67 
 
 		 449 aa  604  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  69.16 
 
 		 460 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  66.67 
 
 		 473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  69.85 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  65.75 
 
 		 470 aa  598  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  66.51 
 
 		 471 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  66.82 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  68.16 
 
 		 455 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  68.16 
 
 		 455 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  68.07 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  65.75 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  68.28 
 
 		 452 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  68.36 
 
 		 470 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  68.06 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  65.05 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  65.06 
 
 		 471 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  66.21 
 
 		 470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  66.59 
 
 		 470 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  64.35 
 
 		 463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  66.67 
 
 		 488 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  67.32 
 
 		 484 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  63.68 
 
 		 477 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  53.6 
 
 		 474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  52.67 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  49.77 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  43.93 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  48.11 
 
 		 472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  38.41 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  41.73 
 
 		 640 aa  206  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  37.69 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  35.84 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  37.64 
 
 		 609 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  37.26 
 
 		 630 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  38.95 
 
 		 373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  30.75 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  29.33 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  27.63 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  27.19 
 
 		 546 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  36.12 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  35.71 
 
 		 359 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  32.36 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  33.44 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  27.08 
 
 		 549 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  34.91 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  36.53 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  30.63 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  35.62 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  35.91 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.04 
 
 		 551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.04 
 
 		 551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.11 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  35.71 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  35.71 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.66 
 
 		 551 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  34.64 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  34.64 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.88 
 
 		 511 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  31.28 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  33.33 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  32.27 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  34.13 
 
 		 338 aa  113  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  29.66 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  39.34 
 
 		 561 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  31.62 
 
 		 584 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  30.12 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  30.12 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  36.22 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  33.2 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  40.15 
 
 		 572 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  34.54 
 
 		 535 aa  110  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>