74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3608 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  100 
 
 		 132 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.04 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1782  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.06 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336195  normal  0.05616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.35 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  33.33 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.31 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  30.17 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0811  hypothetical protein  32.38 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3618  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0730754  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1362  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.82 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1969  anti-ECFsigma factor, ChrR  34 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.39 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0821  hypothetical protein  31.78 
 
 		 214 aa  57  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1225  anti-sigm factor, ChrR  30.77 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.91 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.39 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.39 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1332  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.37 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.469882 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5392  anti-ECFsigma factor, ChrR  30 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0451  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.78 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0586  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.03 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.97 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1946  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.25 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00378013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0423  anti-ECFsigma factor, ChrR  30 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4157  anti-sigm factor, ChrR  30.85 
 
 		 219 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424525 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41079  predicted protein  32.93 
 
 		 243 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4129  anti-ECFsigma factor, ChrR  31 
 
 		 235 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1906  anti-ECFsigma factor, ChrR  29 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0852  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.41 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  29 
 
 		 239 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0025  transcriptional activator anti-ECFsigma factor  32.67 
 
 		 223 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322497  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0264  hypothetical protein  32.65 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3257  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.71 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442246  normal  0.111032 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6445  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.74 
 
 		 244 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3659  acetylacetone-cleaving enzyme  30.85 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4481  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.87 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6449  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.26 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0335897 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6860  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.67 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6152  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.74 
 
 		 222 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3233  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.91 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1793  transcriptional regulator  28 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376612  normal  0.0711079 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1477  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.26 
 
 		 249 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.688237  normal  0.852126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.62 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0309  hypothetical protein  29.51 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1454  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.1 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3373  anti-sigma factor ChrR, putative  30.14 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3840  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.55 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3715  hypothetical protein  29.51 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.59 
 
 		 222 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000626  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.47 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3894  cupin 2 conserved barrel domain protein  29.31 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0304  hypothetical protein  30.91 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0241378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  30.69 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0982  hypothetical protein  28.74 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1005  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.44 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000085079 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  25.74 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  43.37 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0996  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.14 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.26 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3966  acetylacetone-cleaving enzyme  28.26 
 
 		 162 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.382041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4571  hypothetical protein  31.58 
 
 		 168 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1378  putative transcriptional activator  29.41 
 
 		 228 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0339  anti-sigma factor ChrR, putative  28 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2876  hypothetical protein  32.58 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1473  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1642  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.44 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3502  hypothetical protein  34.69 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1715  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.44 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258118  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5650  Allophanate hydrolase  32.39 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0555941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01678  putative transmembrane protein  26.05 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.74 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.74 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.992121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>