More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2746 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2746  putative long chain fatty acid CoA ligase  100 
 
 		 543 aa  1127    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  38.27 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  38.09 
 
 		 549 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  38.09 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  37.15 
 
 		 552 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  37.43 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 566 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  36.96 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  37.15 
 
 		 560 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 554 aa  360  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  34.89 
 
 		 544 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  36.11 
 
 		 549 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  35.73 
 
 		 549 aa  348  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  35.73 
 
 		 549 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 566 aa  345  8e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 553 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 566 aa  342  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  34.64 
 
 		 552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  35.35 
 
 		 547 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  36.82 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  36.75 
 
 		 557 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  36.64 
 
 		 562 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  36.57 
 
 		 557 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  36.19 
 
 		 564 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 843 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  37.13 
 
 		 561 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  34.9 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  37.36 
 
 		 544 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.71 
 
 		 828 aa  324  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 550 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  35.35 
 
 		 605 aa  323  4e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  33.59 
 
 		 550 aa  323  6e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  34.33 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  33.64 
 
 		 550 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  34.14 
 
 		 565 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  35.08 
 
 		 546 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  32.89 
 
 		 549 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 602 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  34.82 
 
 		 575 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  36.26 
 
 		 576 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  36.26 
 
 		 576 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  36.26 
 
 		 576 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  36.26 
 
 		 570 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  36.26 
 
 		 576 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  34.39 
 
 		 550 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  36.26 
 
 		 576 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  36.26 
 
 		 576 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  34.39 
 
 		 560 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 561 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  34.82 
 
 		 576 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 543 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  34.63 
 
 		 579 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 568 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  34.02 
 
 		 560 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  33.7 
 
 		 587 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.96 
 
 		 560 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.93 
 
 		 579 aa  310  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 548 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 579 aa  309  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  33.96 
 
 		 560 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  34.46 
 
 		 575 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 562 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 563 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 584 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 575 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 575 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  34.26 
 
 		 575 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  34.87 
 
 		 538 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 575 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  35.32 
 
 		 576 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 576 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  33.89 
 
 		 572 aa  302  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 540 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  34.19 
 
 		 547 aa  302  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  34.08 
 
 		 576 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  34.44 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  32.84 
 
 		 550 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  34.52 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 558 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 575 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 550 aa  300  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  32.84 
 
 		 549 aa  299  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  31.89 
 
 		 596 aa  299  9e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 551 aa  299  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 540 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  31.89 
 
 		 548 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 540 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  34.71 
 
 		 540 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  32.77 
 
 		 576 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 601 aa  296  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 564 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 		 574 aa  296  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  34.5 
 
 		 538 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 566 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 542 aa  295  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 578 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>