63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1032 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  53.97 
 
 
857 aa  731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  100 
 
 
874 aa  1709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  53.74 
 
 
857 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  51.26 
 
 
856 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  60.31 
 
 
848 aa  847    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  81.22 
 
 
871 aa  1129    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  54.85 
 
 
915 aa  732    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  51.92 
 
 
857 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  54.01 
 
 
907 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  53.02 
 
 
855 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  52.93 
 
 
856 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  53.78 
 
 
904 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  51.6 
 
 
858 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  71.86 
 
 
367 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  71.86 
 
 
367 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  44.92 
 
 
787 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  45.37 
 
 
799 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  53.48 
 
 
799 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  46.01 
 
 
846 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  45.52 
 
 
941 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  46.81 
 
 
835 aa  402  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  45.13 
 
 
769 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  49.66 
 
 
842 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  44.02 
 
 
762 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  48.07 
 
 
639 aa  346  8.999999999999999e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  39.6 
 
 
719 aa  295  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  46.82 
 
 
790 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  37.76 
 
 
740 aa  267  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  37.5 
 
 
741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  37.36 
 
 
680 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  40.18 
 
 
464 aa  190  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  31.15 
 
 
704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  26.26 
 
 
784 aa  122  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2521  translation initiation factor 2  35.16 
 
 
372 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  23.69 
 
 
848 aa  89  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  26.4 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  32.8 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  38.81 
 
 
490 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  41.6 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  43.42 
 
 
488 aa  73.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  34.29 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  33.92 
 
 
466 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  37.89 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  37.89 
 
 
473 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  38.61 
 
 
487 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  39.47 
 
 
341 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.14 
 
 
586 aa  60.1  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  31.34 
 
 
209 aa  58.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0597  Sporulation domain protein  29.75 
 
 
287 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  29.2 
 
 
3242 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  17.91 
 
 
3521 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  18.88 
 
 
3409 aa  52  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  25.4 
 
 
484 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  20.5 
 
 
3471 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  20.5 
 
 
3472 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  24.8 
 
 
489 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  25.91 
 
 
754 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  23.03 
 
 
2353 aa  47  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  42.5 
 
 
258 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  27.73 
 
 
268 aa  45.8  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  19.7 
 
 
548 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  25.38 
 
 
897 aa  45.8  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  19.55 
 
 
524 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>