15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2521 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2521  translation initiation factor 2  100 
 
 
372 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  90.33 
 
 
907 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  90.84 
 
 
464 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  89.87 
 
 
857 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  89.62 
 
 
857 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  70.95 
 
 
915 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  45.45 
 
 
857 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  43.78 
 
 
855 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  42.59 
 
 
858 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  43.94 
 
 
856 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  43.83 
 
 
856 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  39.77 
 
 
904 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  39.02 
 
 
848 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  38.69 
 
 
871 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  63.29 
 
 
874 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>