79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5208 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  91.43 
 
 		 245 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  49.33 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  39.47 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  89.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  27.33 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  37.9 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  32.56 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  32.72 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  31.82 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  29.95 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  27.72 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  32.03 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.92 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  31.54 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  29.94 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  29.94 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  28.48 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  28.48 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  32.86 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  30.57 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  27.75 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  29.19 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  30.51 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  29.17 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  29.66 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  29.86 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  30 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  25.99 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  28.4 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  31.71 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  27.33 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  31.3 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  30.86 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  30.08 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  29.25 
 
 		 189 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  27.81 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  27.01 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  28.48 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12631  hypothetical protein  28.46 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  27.88 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  28.14 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  29.92 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  27.45 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  24.58 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  29.13 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  26.32 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  27.83 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11921  hypothetical protein  27.34 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  0.227688 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0473  hypothetical protein  27.34 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181406  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  34.31 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  25.83 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  31.63 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  25.3 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  29.87 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  29.71 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  26.55 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  31.3 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  27.46 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  26.74 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  27.8 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  23.56 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  29.65 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  26.15 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  34.13 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  29.2 
 
 		 217 aa  42  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  35.71 
 
 		 226 aa  42.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  26.74 
 
 		 266 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  26.74 
 
 		 266 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.28 
 
 		 233 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  23.98 
 
 		 253 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  25.52 
 
 		 223 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  33.07 
 
 		 251 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  25.81 
 
 		 243 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>