145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0311 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  77.39 
 
 		 280 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.96 
 
 		 283 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  70.77 
 
 		 282 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  63.92 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  42.75 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  41.81 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  43.98 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.25 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.21 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  44.52 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  40 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  40.14 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  38.93 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.49 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  38.38 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  38.46 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  43.93 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  43.17 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  41.38 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  38.54 
 
 		 290 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  38.38 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.15 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  38.13 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  44.02 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  38.71 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  38.71 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  35.76 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  40.15 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.49 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  28.4 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  28.92 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.49 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  28.96 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  29.33 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  25.89 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  30.1 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  30.1 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  30.1 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  39.13 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  30.1 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  30.1 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  30.1 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  30.1 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  33.89 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  28.67 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  27.93 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  28.98 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  27.87 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  28.79 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  29.32 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  29.59 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.99 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  29 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  29.46 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.91 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  29.46 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  26.74 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  28.79 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  25 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  29.8 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  28.16 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  26.87 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  30.35 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  26.51 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.03 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.3 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  29.47 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  29.47 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  29.59 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  27.49 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.83 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  27.49 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  28.79 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.29 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  26.32 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  26.99 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  30.16 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  28.14 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.31 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  29.51 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  26.63 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  21.76 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  27.63 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.86 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.76 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  33.51 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.52 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>