87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7163 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  91.16 
 
 
147 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  74.15 
 
 
147 aa  227  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  55.97 
 
 
144 aa  160  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  52.94 
 
 
136 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  47.83 
 
 
143 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  50.36 
 
 
152 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  47.83 
 
 
143 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  44.96 
 
 
148 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 
132 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 
140 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 
150 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  38.97 
 
 
139 aa  103  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.46 
 
 
145 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 
137 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  28.43 
 
 
314 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  34.88 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4124  hypothetical protein  25.93 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158038  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.47 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.74 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.15 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.84 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.11 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  32.94 
 
 
136 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  22.9 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.53 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  19.85 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  23.53 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  22.63 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.91 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.41 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  23.19 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
165 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.03 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.93 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51510  hypothetical protein  25 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000170599  hitchhiker  0.0000345324 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  23.08 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  20.9 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.33 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  18.68 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  20.45 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2577  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 
192 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 
163 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.05 
 
 
145 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.53 
 
 
140 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 
163 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.46 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.36 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.46 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  24.63 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  25 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.33 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.32 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  23.91 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.47 
 
 
285 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2260  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.96 
 
 
141 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2770  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.96 
 
 
141 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397297  normal  0.706445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.68 
 
 
161 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.35 
 
 
149 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  22.48 
 
 
136 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.63 
 
 
161 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>