54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4674 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  73.72 
 
 		 138 aa  207  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  69.12 
 
 		 155 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.74 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.2 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.91 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  47.41 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.83 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.83 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.35 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  44.83 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.1 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 139 aa  95.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  39.23 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  37.93 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  27.59 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  40.2 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  28.83 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.69 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  30.33 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  30.09 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  35.53 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  27.1 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.72 
 
 		 166 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  26.72 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.72 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.32 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  25.86 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  34.02 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.86 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  28.92 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.32 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  30.77 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  26.71 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  31.25 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 184 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  27 
 
 		 186 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>