More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2399 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  49.93 
 
 		 801 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  73.43 
 
 		 734 aa  1048    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  67.54 
 
 		 741 aa  974    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  67.54 
 
 		 752 aa  973    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  64.48 
 
 		 745 aa  959    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  66.33 
 
 		 737 aa  977    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  75.15 
 
 		 725 aa  1053    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  75.84 
 
 		 729 aa  1089    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  72.41 
 
 		 750 aa  1044    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 729 aa  1498    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  67.1 
 
 		 738 aa  976    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  70.01 
 
 		 754 aa  1074    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  74.82 
 
 		 729 aa  1061    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  69.88 
 
 		 754 aa  1073    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  67.54 
 
 		 753 aa  977    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6529  TonB-dependent siderophore receptor  74.85 
 
 		 725 aa  1049    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  67.54 
 
 		 736 aa  973    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  70.71 
 
 		 750 aa  1096    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6367  TonB-dependent siderophore receptor  74.67 
 
 		 729 aa  1061    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  69.88 
 
 		 754 aa  1073    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  67.54 
 
 		 753 aa  977    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6763  TonB-dependent siderophore receptor  74.85 
 
 		 725 aa  1049    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  70.56 
 
 		 753 aa  1097    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  67.54 
 
 		 736 aa  973    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  44.54 
 
 		 806 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  37.54 
 
 		 808 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.06 
 
 		 833 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  36.52 
 
 		 729 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  36.23 
 
 		 810 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 		 808 aa  425  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  36.21 
 
 		 829 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  35.83 
 
 		 810 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  35.55 
 
 		 802 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  37.74 
 
 		 821 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  37.55 
 
 		 819 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.34 
 
 		 797 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 		 810 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 810 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 754 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.71 
 
 		 806 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  37.21 
 
 		 745 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  34.1 
 
 		 815 aa  395  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  37 
 
 		 744 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 769 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 778 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 		 744 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 		 750 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 789 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 		 747 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.96 
 
 		 799 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  31.52 
 
 		 747 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  33.96 
 
 		 729 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 701 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 740 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 817 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  31.52 
 
 		 747 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 		 723 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 		 745 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  32.06 
 
 		 747 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 		 791 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  31.38 
 
 		 747 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 717 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  31.52 
 
 		 747 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 745 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  31.38 
 
 		 747 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 829 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  31.78 
 
 		 745 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  34.58 
 
 		 791 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 705 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 820 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 		 735 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 717 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  31.4 
 
 		 729 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  33.89 
 
 		 719 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  31.19 
 
 		 729 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 794 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  31.54 
 
 		 703 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  31.54 
 
 		 703 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 665 aa  364  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  31.59 
 
 		 729 aa  364  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  30.78 
 
 		 752 aa  363  8e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 747 aa  360  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 728 aa  360  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 		 771 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 		 771 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  31.52 
 
 		 747 aa  360  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 733 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 728 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 748 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 828 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  33.62 
 
 		 740 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 701 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  33.48 
 
 		 724 aa  351  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 797 aa  350  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  33.48 
 
 		 696 aa  350  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 831 aa  350  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 696 aa  349  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  33.33 
 
 		 696 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  31.72 
 
 		 719 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>