More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1264 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1264  transglutaminase domain protein  100 
 
 
310 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000508842  normal  0.510233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3281  transglutaminase-like domain-containing protein  92.26 
 
 
302 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1823  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  51.32 
 
 
309 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  47.85 
 
 
297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  48.18 
 
 
290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  47.85 
 
 
290 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  47.37 
 
 
300 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3978  transglutaminase-like  47.37 
 
 
304 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0967  transglutaminase-like  46.71 
 
 
301 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  hitchhiker  0.00428968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2635  transglutaminase domain-containing protein  45.02 
 
 
311 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000599705  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4135  transglutaminase-like  46.05 
 
 
304 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0273  transglutaminase domain-containing protein  47.04 
 
 
328 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.260289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1408  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 
302 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.543659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2469  transglutaminase domain-containing protein  44.48 
 
 
313 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.451679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1061  transglutaminase domain-containing protein  40.73 
 
 
314 aa  225  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  40.91 
 
 
302 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  38.74 
 
 
290 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4755  transglutaminase domain protein  39.14 
 
 
302 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  37.75 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  36.51 
 
 
305 aa  199  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  38.69 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  37.91 
 
 
313 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  37.01 
 
 
291 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  36.08 
 
 
287 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9053  hypothetical protein  37.45 
 
 
273 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3752  hypothetical protein  30 
 
 
1114 aa  139  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2947  hypothetical protein  31.34 
 
 
1103 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.104803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3324  transglutaminase domain-containing protein  33 
 
 
291 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  28.38 
 
 
1108 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  32.51 
 
 
1118 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  34.93 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0067  transglutaminase-like  31.8 
 
 
1147 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  31.86 
 
 
1091 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1701  transglutaminase-like  30.04 
 
 
1090 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126756  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  32.4 
 
 
1169 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  28.05 
 
 
1108 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  30.63 
 
 
1128 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  30.99 
 
 
1114 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  32.39 
 
 
1091 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0655  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 
1097 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.559922  hitchhiker  0.000135984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3159  transglutaminase-like  29.47 
 
 
1217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.668757  normal  0.863803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  30.07 
 
 
1121 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  29.27 
 
 
1116 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4489  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
1142 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3415  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 
1116 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296016  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3405  transglutaminase domain protein  30.74 
 
 
1180 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  30.9 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  31.06 
 
 
1092 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4275  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 
1113 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0684346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  31 
 
 
1081 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  30.18 
 
 
1136 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3724  transglutaminase domain protein  33.21 
 
 
1116 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565418  normal  0.0894015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 
1158 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  30.72 
 
 
1092 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  31.86 
 
 
1144 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5075  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 
1080 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804608  normal  0.120829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  31.34 
 
 
1117 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0541  transglutaminase-like  30.39 
 
 
1091 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.649463  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
1149 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  29.68 
 
 
1100 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2470  transglutaminase domain-containing protein  30.18 
 
 
1122 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4406  transglutaminase domain protein  30.07 
 
 
1157 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2246  transglutaminase domain protein  32.45 
 
 
1145 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0210  transglutaminase domain protein  30.04 
 
 
1122 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4766  transglutaminase domain protein  29.5 
 
 
290 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  31.82 
 
 
1188 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0725  transglutaminase family protein  30.07 
 
 
1157 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101578  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3608  transglutaminase domain protein  32.6 
 
 
1104 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  0.238952 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  30.04 
 
 
1140 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  30.04 
 
 
1140 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  30.04 
 
 
1140 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  30.04 
 
 
1140 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  30.04 
 
 
1140 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  30.04 
 
 
1140 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  28.81 
 
 
1137 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  30.04 
 
 
1140 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  28.81 
 
 
1137 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  28.81 
 
 
1137 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1218  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 
1135 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.695465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  29.58 
 
 
1120 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  29.58 
 
 
1120 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0393  transglutaminase domain-containing protein  29.82 
 
 
1114 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  28.82 
 
 
1148 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  30.38 
 
 
1090 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  28.77 
 
 
1142 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  30.13 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0857  transglutaminase domain protein  28.38 
 
 
1112 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250645  normal  0.314962 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  32.82 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  29.55 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  28.32 
 
 
1100 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  28.67 
 
 
1107 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.95635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2605  transglutaminase domain-containing protein  28.62 
 
 
1174 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0954  transglutaminase-like domain-containing protein  28.67 
 
 
1173 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  30 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4490  transglutaminase domain protein  26.8 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4426  transglutaminase domain protein  26.8 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  29.33 
 
 
1145 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  28.83 
 
 
296 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  27.81 
 
 
295 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  30.8 
 
 
279 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>