More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0273 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0273  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  663    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.260289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  57.93 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3978  transglutaminase-like  51.84 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  51.17 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4135  transglutaminase-like  51.21 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1408  transglutaminase domain protein  49.67 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.543659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0967  transglutaminase-like  50 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  hitchhiker  0.00428968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  49.66 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  48.5 
 
 		 297 aa  272  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  48.98 
 
 		 290 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  46.71 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3281  transglutaminase-like domain-containing protein  48.33 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1823  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2635  transglutaminase domain-containing protein  46.84 
 
 		 311 aa  255  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000599705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1264  transglutaminase domain protein  46.71 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000508842  normal  0.510233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  44.44 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4755  transglutaminase domain protein  43.66 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  45.33 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2469  transglutaminase domain-containing protein  44 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.451679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  42.96 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1061  transglutaminase domain-containing protein  43.15 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  38.72 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  36.64 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  40.14 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3324  transglutaminase domain-containing protein  38.19 
 
 		 291 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  41.32 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9053  hypothetical protein  44.09 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  35.49 
 
 		 1091 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  35.52 
 
 		 1090 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  33.95 
 
 		 1100 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1392  transglutaminase-like enzyme, cysteine protease  33.45 
 
 		 1151 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.284441  normal  0.67203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0541  transglutaminase-like  35.27 
 
 		 1091 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.649463  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  34.32 
 
 		 1117 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  33.7 
 
 		 1121 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0655  transglutaminase domain-containing protein  35.38 
 
 		 1097 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.559922  hitchhiker  0.000135984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 1092 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0067  transglutaminase-like  35.04 
 
 		 1147 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2628  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 		 1112 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4275  transglutaminase domain protein  34.07 
 
 		 1113 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0684346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3771  transglutaminase domain-containing protein  34.46 
 
 		 1133 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510583  normal  0.20356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2320  transglutaminase-like protein  33.11 
 
 		 1108 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0950324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2367  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 		 1108 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2359  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 		 1108 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  32.41 
 
 		 1188 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  34.77 
 
 		 1158 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  32.6 
 
 		 1092 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2605  transglutaminase domain-containing protein  33.67 
 
 		 1174 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  32.07 
 
 		 1100 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3159  transglutaminase-like  31.73 
 
 		 1217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.668757  normal  0.863803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3512  transglutaminase domain protein  32.36 
 
 		 1141 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2947  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1103 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  32.61 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  31.39 
 
 		 1116 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  31.85 
 
 		 1136 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3415  transglutaminase domain-containing protein  34.31 
 
 		 1116 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3724  transglutaminase domain protein  34.31 
 
 		 1116 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565418  normal  0.0894015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  32.84 
 
 		 1128 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  34.14 
 
 		 1169 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1014  transglutaminase domain protein  33.58 
 
 		 1128 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2246  transglutaminase domain protein  31.9 
 
 		 1145 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0393  transglutaminase domain-containing protein  32 
 
 		 1114 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  32.47 
 
 		 1114 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  33.82 
 
 		 1118 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12586  hypothetical protein  32.62 
 
 		 1140 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4758  transglutaminase domain-containing protein  33 
 
 		 1125 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446948  normal  0.0794526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4489  transglutaminase domain-containing protein  32.88 
 
 		 1142 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  31.19 
 
 		 1108 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  33.22 
 
 		 1120 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  33.22 
 
 		 1120 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  32.34 
 
 		 1155 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1218  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1135 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.695465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  32.69 
 
 		 1091 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  34.55 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  30.85 
 
 		 1108 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3608  transglutaminase domain protein  32.84 
 
 		 1104 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  0.238952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0725  transglutaminase family protein  31.61 
 
 		 1157 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  31.85 
 
 		 1081 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1701  transglutaminase-like  32.04 
 
 		 1090 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126756  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  32.19 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3405  transglutaminase domain protein  31.85 
 
 		 1180 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  32.31 
 
 		 1148 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4406  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 		 1157 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0988  transglutaminase domain-containing protein  29.97 
 
 		 1119 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  33.45 
 
 		 1137 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 		 1137 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  33.45 
 
 		 1137 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0857  transglutaminase domain protein  33.21 
 
 		 1112 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250645  normal  0.314962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5075  transglutaminase domain-containing protein  32.47 
 
 		 1080 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804608  normal  0.120829 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 1140 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 1140 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 1140 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  34.78 
 
 		 1140 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 1140 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 1140 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 1140 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  32.86 
 
 		 1139 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  35.51 
 
 		 1145 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  31.85 
 
 		 1144 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  32.36 
 
 		 1149 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  32.31 
 
 		 1142 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2470  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 1122 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>