More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0725 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  53.74 
 
 
1120 aa  1197    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  63.09 
 
 
1118 aa  1450    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  54.89 
 
 
1081 aa  1209    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  61.42 
 
 
1092 aa  1400    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  68.59 
 
 
1140 aa  1606    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  48.54 
 
 
1155 aa  1025    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0210  transglutaminase domain protein  54.09 
 
 
1122 aa  1209    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  57.01 
 
 
1136 aa  1240    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  68.59 
 
 
1140 aa  1606    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  68.27 
 
 
1140 aa  1606    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  61.07 
 
 
1092 aa  1394    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  68.28 
 
 
1148 aa  1623    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  61.94 
 
 
1117 aa  1457    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0067  transglutaminase-like  73.32 
 
 
1147 aa  1719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2246  transglutaminase domain protein  55.2 
 
 
1145 aa  1235    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  68.67 
 
 
1140 aa  1609    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4406  transglutaminase domain protein  95.76 
 
 
1157 aa  2244    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298511 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  68.36 
 
 
1140 aa  1608    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  44.73 
 
 
1078 aa  916    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0541  transglutaminase-like  62.28 
 
 
1091 aa  1408    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.649463  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  68.82 
 
 
1169 aa  1642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  68.29 
 
 
1144 aa  1619    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0954  transglutaminase-like domain-containing protein  53.97 
 
 
1173 aa  1164    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3771  transglutaminase domain-containing protein  49.16 
 
 
1133 aa  1031    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510583  normal  0.20356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  55.42 
 
 
1188 aa  1301    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  68.95 
 
 
1142 aa  1636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3608  transglutaminase domain protein  54.46 
 
 
1104 aa  1210    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  0.238952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3512  transglutaminase domain protein  50.88 
 
 
1141 aa  1213    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2947  hypothetical protein  56.1 
 
 
1103 aa  1253    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.104803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  61.81 
 
 
1158 aa  1414    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  59.03 
 
 
1090 aa  661    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3017  transglutaminase domain-containing protein  54.88 
 
 
1127 aa  1157    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0756013  normal  0.525776 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  54.48 
 
 
1100 aa  1224    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  68.55 
 
 
1145 aa  1609    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  55.48 
 
 
1114 aa  1264    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0655  transglutaminase domain-containing protein  64.82 
 
 
1097 aa  1419    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.559922  hitchhiker  0.000135984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3724  transglutaminase domain protein  54.5 
 
 
1116 aa  1219    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565418  normal  0.0894015 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  53.74 
 
 
1120 aa  1197    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0857  transglutaminase domain protein  53.61 
 
 
1112 aa  1172    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250645  normal  0.314962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3752  hypothetical protein  52.46 
 
 
1114 aa  1188    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139209  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2470  transglutaminase domain-containing protein  55.1 
 
 
1122 aa  1237    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  53.85 
 
 
1116 aa  1251    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1701  transglutaminase-like  55.57 
 
 
1090 aa  1241    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126756  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4275  transglutaminase domain protein  54.66 
 
 
1113 aa  1222    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0684346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5075  transglutaminase domain-containing protein  54.28 
 
 
1080 aa  1190    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804608  normal  0.120829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1218  transglutaminase domain-containing protein  64.83 
 
 
1135 aa  1579    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.695465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3159  transglutaminase-like  66.26 
 
 
1217 aa  1638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.668757  normal  0.863803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  53.92 
 
 
1108 aa  1225    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0725  transglutaminase family protein  100 
 
 
1157 aa  2360    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101578  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  55.13 
 
 
1091 aa  1189    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1014  transglutaminase domain protein  56.45 
 
 
1128 aa  1263    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4758  transglutaminase domain-containing protein  52.85 
 
 
1125 aa  1135    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446948  normal  0.0794526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  55.28 
 
 
1128 aa  1263    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4489  transglutaminase domain-containing protein  80.99 
 
 
1142 aa  1932    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  55.79 
 
 
1091 aa  1202    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  69.56 
 
 
1137 aa  1645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  68.36 
 
 
1140 aa  1608    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2320  transglutaminase-like protein  50.13 
 
 
1108 aa  1012    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0950324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1392  transglutaminase-like enzyme, cysteine protease  51.98 
 
 
1151 aa  1209    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.284441  normal  0.67203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3415  transglutaminase domain-containing protein  54.45 
 
 
1116 aa  1218    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296016  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  68 
 
 
1149 aa  1622    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2359  transglutaminase domain-containing protein  49.41 
 
 
1108 aa  1005    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  54.06 
 
 
1107 aa  1145    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.95635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  55.85 
 
 
1121 aa  1248    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  69.56 
 
 
1137 aa  1645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0393  transglutaminase domain-containing protein  51.91 
 
 
1114 aa  1201    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3405  transglutaminase domain protein  67.26 
 
 
1180 aa  1629    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  68.67 
 
 
1140 aa  1609    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  54.11 
 
 
1108 aa  1225    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2367  transglutaminase domain-containing protein  50.13 
 
 
1108 aa  1012    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021822  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2605  transglutaminase domain-containing protein  70.63 
 
 
1174 aa  1686    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2628  transglutaminase domain-containing protein  50.35 
 
 
1112 aa  1018    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329937  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  69.91 
 
 
1137 aa  1652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0988  transglutaminase domain-containing protein  52.86 
 
 
1119 aa  1198    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  60.62 
 
 
1100 aa  1441    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  58.75 
 
 
1139 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12586  hypothetical protein  51.13 
 
 
1140 aa  529  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265908  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1477  hypothetical protein  47.71 
 
 
731 aa  402  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.288638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  53.95 
 
 
289 aa  317  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0892  transglutaminase domain protein  45.3 
 
 
277 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 
279 aa  211  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2052  Protein of unknown function DUF2126  34.71 
 
 
697 aa  181  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.598866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4426  transglutaminase domain protein  37.73 
 
 
296 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4490  transglutaminase domain protein  37.73 
 
 
296 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  35.74 
 
 
291 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  36.52 
 
 
276 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  35.27 
 
 
313 aa  149  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  33.99 
 
 
291 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  32.87 
 
 
305 aa  146  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  35.71 
 
 
300 aa  146  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  34.4 
 
 
302 aa  146  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  31.74 
 
 
290 aa  144  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  31.74 
 
 
290 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4755  transglutaminase domain protein  34.17 
 
 
302 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  34.16 
 
 
302 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4766  transglutaminase domain protein  32.73 
 
 
290 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  32.61 
 
 
309 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  33.58 
 
 
287 aa  135  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1061  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 
314 aa  134  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.138464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>