More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4990 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  76.69 
 
 		 432 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  74.88 
 
 		 435 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  76.76 
 
 		 433 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  73.26 
 
 		 439 aa  636    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  867    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  74.88 
 
 		 435 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  52.36 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  44.2 
 
 		 441 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3079  MFS family transporter  43.58 
 
 		 441 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  33.8 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 435 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0530  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 443 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  34.06 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  34.76 
 
 		 451 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 442 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.72 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  31.76 
 
 		 436 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  32.78 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  32.32 
 
 		 436 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  32.36 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  29.5 
 
 		 447 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.51 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  31.21 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  30.02 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  31.03 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 450 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  29.88 
 
 		 436 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  29.88 
 
 		 436 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  29.88 
 
 		 436 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  29.37 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  30.17 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  29.88 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  30.7 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  30.53 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  29.35 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  32.21 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  30.97 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 469 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 463 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  29.59 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 455 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  31.97 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 463 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 463 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  31.97 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  29.89 
 
 		 461 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  29.89 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  30.07 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  29.9 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  29.9 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  29.9 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  29.9 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  29.9 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  29.9 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  29.9 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  29.9 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  29.59 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  29.59 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  29.59 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  29.59 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  30.38 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  29.59 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  30.07 
 
 		 485 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  29.59 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  29.59 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  29.98 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  29.98 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  29.98 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>