86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1186 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1186  nuclear protein SET  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1219  hypothetical protein  65.52 
 
 		 146 aa  200  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0581  hypothetical protein  63.01 
 
 		 160 aa  194  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.434598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4201  nuclear protein SET  65.28 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.054698 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7591  nuclear protein SET  65.49 
 
 		 149 aa  190  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3926  nuclear protein SET  56.67 
 
 		 174 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0006  hypothetical protein  55.33 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3059  nuclear protein SET  57.24 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.931028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0073  nuclear protein SET  55.1 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3254  SET domain-containing protein  54.42 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2982  nuclear protein SET  54.42 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3230  nuclear protein SET  54.05 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0073  nuclear protein SET  54.42 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0091  nuclear protein SET  54.42 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0064  nuclear protein SET  55.56 
 
 		 178 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3537  nuclear protein SET  54.79 
 
 		 170 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0072  nuclear protein SET  54.86 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3554  nuclear protein SET  54.05 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3391  nuclear protein SET  54.93 
 
 		 172 aa  166  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0187167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3358  hypothetical protein  54.11 
 
 		 179 aa  166  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0264  hypothetical protein  54.86 
 
 		 173 aa  164  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3341  SET domain-containing protein  52.38 
 
 		 303 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  53.47 
 
 		 210 aa  162  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1621  SET domain-containing protein  52.38 
 
 		 187 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2980  SET domain-containing protein  52.38 
 
 		 187 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4007  SET domain-containing protein  52.38 
 
 		 187 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4081  SET domain-containing protein  52.38 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3389  SET domain-containing protein  52.38 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0210  SET domain-containing protein  52.38 
 
 		 187 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2921  SET domain-containing protein  52.38 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4715  nuclear protein SET  50.67 
 
 		 230 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  50.34 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  53.1 
 
 		 179 aa  150  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0004  nuclear protein SET  49.66 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.437356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0004  nuclear protein SET  50 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.494883  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  48.61 
 
 		 252 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  49.31 
 
 		 213 aa  146  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3954  nuclear protein SET  49.31 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.344264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  48.61 
 
 		 213 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  48.61 
 
 		 184 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  48.15 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  44.97 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  44.97 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  44.3 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  44.3 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3934  nuclear protein SET  41.1 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4528  nuclear protein SET  36.23 
 
 		 223 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.853284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2228  nuclear protein SET  36.55 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.06924  normal  0.46307 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  35.42 
 
 		 1055 aa  82  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  36.99 
 
 		 1220 aa  78.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  35.1 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  38.46 
 
 		 860 aa  70.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  33.1 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  32 
 
 		 503 aa  67  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  32 
 
 		 503 aa  67  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6093  predicted protein  32.85 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897859  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  39.42 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  28.47 
 
 		 1469 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0045  hypothetical protein  36.96 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00197887  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  34.67 
 
 		 495 aa  63.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  34.95 
 
 		 197 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4245  nuclear protein SET  33.33 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25709  predicted protein  31.68 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  35.92 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16875  predicted protein  27.82 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4392  nuclear protein SET  38.46 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304271  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  30.56 
 
 		 1782 aa  61.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  31.94 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  33.33 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  32.64 
 
 		 980 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1714  nuclear protein SET  29.29 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1538  nuclear protein SET  33.65 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3759  nuclear protein SET  32.04 
 
 		 250 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  29.63 
 
 		 834 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04764  histone-lysine N-methyltransferase (Ash1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06480)  27.97 
 
 		 812 aa  54.7  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2041  nuclear protein SET  29.29 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266268  normal  0.332033 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19017  predicted protein  32.46 
 
 		 980 aa  53.9  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238798 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01170  histone-lysine N-methyltransferase Clr4 (AFU_orthologue; AFUA_1G11090)  27.56 
 
 		 551 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00900  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 		 380 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.709683  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0731  nuclear protein SET  30.5 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.121833  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32372  predicted protein  28.85 
 
 		 931 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1893  nuclear protein SET  32.41 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1535  hypothetical protein  28.97 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00720131  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0979  nuclear protein SET  33.04 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87957  predicted protein  33.05 
 
 		 205 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2656  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>