More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2508 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0215  short chain dehydrogenase  60.52 
 
 
275 aa  343  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18450  short chain dehydrogenase  59.12 
 
 
279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0882393  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1001  short chain dehydrogenase  60.15 
 
 
301 aa  316  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3000  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
272 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0641388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4340  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 
280 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0293254  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
306 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.47 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.288274  normal  0.29741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.04 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.57 
 
 
266 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.64422 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
255 aa  89  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5231  short chain dehydrogenase  25 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0476444  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
276 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
285 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  26.91 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  26.91 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  26.91 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.84 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.3 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.97 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439013  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  27.99 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.04 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  27.97 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  27.97 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.02 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.09 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  28.32 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.46 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  26.74 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3604  putative dehydrogenase  28.4 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055827  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.07 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.2 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.03 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.37 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.71 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  26.5 
 
 
257 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.56 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.26 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  26.84 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.07 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.35 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  24.56 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.18 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.35 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.94 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  25 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.93 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.44 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.49 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00370  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  29.02 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.170907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.36 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.47 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  28.25 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.44 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.26 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  27.51 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.36 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  27.44 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.82 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.145372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.28 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.01 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.4 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  27.11 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.83 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.4 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.32 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  23.99 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  25.19 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.37 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.26 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.76 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.51 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.8 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  26.32 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959898  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.49 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.34 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  27.82 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.5 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  26.77 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>