34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0658 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  100 
 
 
207 aa  426  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  43.08 
 
 
204 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  36.92 
 
 
473 aa  152  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  38.46 
 
 
204 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  34.78 
 
 
209 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  29.9 
 
 
201 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  29.15 
 
 
428 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  31.68 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  24.88 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  24.12 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  24.12 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  25.13 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  21.52 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  23.19 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  21.83 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  24.51 
 
 
276 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  27.89 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  21.43 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  25.98 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  22.86 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  19.44 
 
 
271 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  19.44 
 
 
271 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  21.83 
 
 
273 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  21.39 
 
 
238 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  22.7 
 
 
273 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  21.72 
 
 
273 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  22.22 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  20.9 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  22.8 
 
 
231 aa  45.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  21.58 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  22.96 
 
 
271 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  21.84 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  23.15 
 
 
310 aa  41.6  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  21.84 
 
 
234 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>