More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2463 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
423 aa  864    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2686  LuxR family regulatory protein  54.36 
 
 
203 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3282  LuxR family transcriptional regulator  51.34 
 
 
202 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4609  LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
181 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187636  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0982  LuxR family transcriptional regulator  52.43 
 
 
228 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1464  LuxR family transcriptional regulator  52.43 
 
 
228 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3128  LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 
181 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1785  LuxR family transcriptional regulator  52.2 
 
 
228 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2762  transcriptional regulator, LuxR family  51.96 
 
 
181 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1442  LuxR family transcriptional regulator  52.78 
 
 
181 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1109  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
181 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0705073  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1551  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
181 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1876  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
181 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2609  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
181 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0214  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
181 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1698  PAS  51.67 
 
 
181 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1723  sensory box transcriptional regulator  51.67 
 
 
181 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0949  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
181 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1960  LuxR family transcriptional regulator  51.41 
 
 
181 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1761  transcriptional regulator, LuxR family  51.41 
 
 
181 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1904  LuxR family transcriptional regulator  53.07 
 
 
184 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1389  LuxR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
181 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1349  LuxR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
181 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2659  putative PAS/PAC sensor protein  50.83 
 
 
184 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1564  LuxR family transcriptional regulator  50.28 
 
 
181 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1569  putative transcription regulator protein  49.72 
 
 
181 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1984  transcriptional regulator, LuxR family  49.72 
 
 
181 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1654  transcriptional regulator, LuxR family  49.72 
 
 
181 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00914552  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1365  LuxR family transcriptional regulator  50.28 
 
 
181 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4267  LuxR family transcriptional regulator  50.29 
 
 
180 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130529  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1152  LuxR family transcriptional regulator  48.6 
 
 
181 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1268  LuxR family transcriptional regulator  48.6 
 
 
181 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.550511  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1455  LuxR family transcriptional regulator  49.72 
 
 
197 aa  189  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231735  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2636  LuxR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
206 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3263  transcriptional regulator, LuxR family  47.57 
 
 
188 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3273  LuxR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
185 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1985  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
185 aa  176  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1516  LuxR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
182 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300196  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3436  LuxR family transcriptional regulator  43.39 
 
 
190 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5257  LuxR family transcriptional regulator  43.39 
 
 
201 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272579  normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22220  Transcriptional regulator, LuxR family  39.78 
 
 
188 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4682  putative PAS/PAC sensor protein  38.07 
 
 
192 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.706561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  49.24 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  49.24 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  48.12 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  45.45 
 
 
363 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  45.45 
 
 
626 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  43.18 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  42.42 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  42.42 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  42.42 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  40.46 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  40.46 
 
 
363 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  40.46 
 
 
363 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  44.8 
 
 
362 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  44.8 
 
 
362 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  43.94 
 
 
363 aa  90.9  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  44.8 
 
 
362 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  44.8 
 
 
389 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  39.53 
 
 
365 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  40.15 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  41.35 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  41.35 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  41.35 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  41.35 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  41.35 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  41.35 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  40.15 
 
 
367 aa  87.4  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  40.15 
 
 
367 aa  87.4  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  40.15 
 
 
340 aa  86.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  40.15 
 
 
362 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  40.15 
 
 
362 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  40.15 
 
 
370 aa  87  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  40.15 
 
 
370 aa  87  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  40.15 
 
 
362 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  40.15 
 
 
362 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  40.91 
 
 
362 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  40.31 
 
 
366 aa  86.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4922  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.19 
 
 
617 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.051397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  42.86 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  38.64 
 
 
364 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  39.39 
 
 
362 aa  84  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  40.91 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  36.84 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  36.84 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>