More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2154 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2208  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.4 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  55.3 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  55.09 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  55.09 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 		 221 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 219 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  51.38 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  50.92 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  51.83 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  48.85 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.69 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.29 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  53.21 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  50.7 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  49.31 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  50.92 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  50.92 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 219 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  50.92 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  50.92 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  50.92 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  50.92 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  50.92 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 221 aa  193  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  47.71 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  45.12 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  43.93 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.74 
 
 		 218 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  41.28 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  46.54 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  44.91 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  42.27 
 
 		 232 aa  184  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.24 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  42.27 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  48.6 
 
 		 255 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.65 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  48.6 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  48.6 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  48.6 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  48.6 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  48.6 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  48.6 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  40.09 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  43.06 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.45 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  42.59 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3148  two component response regulator  46.38 
 
 		 225 aa  178  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.174373  hitchhiker  0.000575412 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  43.32 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  44.95 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>