46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0338 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 278 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  48.12 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  49.25 
 
 		 278 aa  251  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  45.52 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  44.15 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.31 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  40.46 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  46.76 
 
 		 221 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  63.77 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  38.04 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  36.46 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.62 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  34.92 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5175  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.33 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  48.03 
 
 		 228 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  31.02 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1405  hypothetical protein  48.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1169  hypothetical protein  48.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0204428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  49.25 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1896  hypothetical protein  48.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  49.25 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  49.25 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  49.62 
 
 		 292 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1399  putative transmembrane anti-sigma factor  48.92 
 
 		 305 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.910327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  49.23 
 
 		 322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.77 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  33.58 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  39.78 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1812  putative transmembrane anti-sigma factor  46.38 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  32.73 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  25.53 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  28 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  24.91 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  27.09 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  24.91 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  24.91 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1713  putative transmembrane anti-sigma factor  28.17 
 
 		 78 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  26.58 
 
 		 88 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  23.08 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  26.98 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  27.54 
 
 		 84 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  24.38 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  25.68 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>