More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0132 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 271 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  71.38 
 
 		 272 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  65.66 
 
 		 267 aa  344  8e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  65.66 
 
 		 267 aa  344  8e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  66.04 
 
 		 267 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  64.91 
 
 		 265 aa  335  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  63.91 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  64.18 
 
 		 279 aa  327  9e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  61.89 
 
 		 265 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  63.53 
 
 		 268 aa  321  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  64.15 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  62.69 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  63.28 
 
 		 277 aa  315  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  61.34 
 
 		 271 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  62.69 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  63.57 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  60.97 
 
 		 272 aa  301  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  56.51 
 
 		 289 aa  297  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  55.97 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  61.19 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  60.82 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  60.22 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  59.11 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  57.25 
 
 		 269 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 274 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  54.48 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  56.72 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  56.88 
 
 		 269 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  56.51 
 
 		 269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  57.62 
 
 		 269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  52.85 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  55.22 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  52.24 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  51.7 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  53.58 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 263 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  46.97 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  47.57 
 
 		 273 aa  228  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  46.59 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  47.57 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  55.79 
 
 		 241 aa  225  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  43.77 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2663  dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2289  Dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238746 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  47.04 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  43.77 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  46.97 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 265 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  45.69 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  44.94 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  47.06 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  45.08 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  47.57 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  44.81 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 268 aa  215  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  44.61 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  45.08 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>