231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30170  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
148 aa  287  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.758763  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2519  regulatory protein ArsR  61.74 
 
 
121 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  64.42 
 
 
108 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  63.46 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  63.46 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  60.36 
 
 
119 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3317  regulatory protein, ArsR  58.88 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0899623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  54 
 
 
118 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  53.54 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 
124 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 
116 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3553  regulatory protein, ArsR  47.57 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3252  regulatory protein ArsR  50 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.19 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  53.97 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  35.35 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.67 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
117 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  39.42 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  51.67 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  47.62 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  40.18 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  47.62 
 
 
112 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  37.38 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  33.94 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.76 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  34.23 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
267 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  25.47 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  50.85 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.09 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  49.21 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  48.33 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  35.35 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
330 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  37.36 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 
118 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 
118 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 
109 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  45.9 
 
 
250 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  53.7 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
137 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  30.71 
 
 
263 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>