More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27840 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27840  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
374 aa  748    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1383  Alkanesulfonate monooxygenase  49.05 
 
 
366 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.147426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2771  Alkanesulfonate monooxygenase  49.61 
 
 
384 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2768  Alkanesulfonate monooxygenase  50.28 
 
 
374 aa  319  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3219  alkansulfonate monooxygenase, putative  47.8 
 
 
366 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31330  alkanesulfonate monooxygenase  48.62 
 
 
363 aa  316  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30490  putative lavin-dependent oxidoreductase  48.62 
 
 
360 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5047  alkanesulfonate monooxygenase  46.7 
 
 
365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2667  alkanesulfonate monooxygenase  46.56 
 
 
364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127339  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2218  luciferase-like protein  46.7 
 
 
363 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.166326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4110  alkanesulfonate monooxygenase  47.74 
 
 
361 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.632894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3261  alkanesulfonate monooxygenase  47.74 
 
 
361 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4256  alkanesulfonate monooxygenase  47.74 
 
 
361 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000537862  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1755  alkanesulfonate monooxygenase  47.74 
 
 
361 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0331181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2515  alkanesulfonate monooxygenase  48.77 
 
 
359 aa  309  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.994703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4334  alkanesulfonate monooxygenase  47.47 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308475  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4153  alkanesulfonate monooxygenase  47.18 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579366  normal  0.316224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21850  alkanesulfonate monooxygenase  45.31 
 
 
369 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1980  putative FMNH2-dependent aliphatic sulphonate monooxygenase  43.99 
 
 
367 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2534  alkanesulfonate monooxygenase  45.88 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127986  normal  0.0153596 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5013  alkanesulfonate monooxygenase  45.98 
 
 
368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4595  Alkanesulfonate monooxygenase  45.08 
 
 
363 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4461  Alkanesulfonate monooxygenase  45.08 
 
 
363 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233107  normal  0.524611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3599  alkanesulfonate monooxygenase  45.68 
 
 
362 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.106793  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3871  Alkanesulfonate monooxygenase  44.17 
 
 
369 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1546  Alkanesulfonate monooxygenase  46.58 
 
 
359 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1331  Alkanesulfonate monooxygenase  47.95 
 
 
365 aa  295  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.733537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1171  alkanesulfonate monooxygenase  48.48 
 
 
365 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324707  normal  0.0191979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1795  alkanesulfonate monooxygenase, putative  44.89 
 
 
362 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  46.07 
 
 
358 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4841  alkanesulfonate monooxygenase  47.41 
 
 
364 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2509  alkanesulfonate monooxygenase  47.81 
 
 
364 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3680  alkanesulfonate monooxygenase  47.18 
 
 
390 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4896  Alkanesulfonate monooxygenase  46.85 
 
 
365 aa  290  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2669  Alkanesulfonate monooxygenase  47.2 
 
 
377 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3308  putative sulfonate monooxygenase  44.66 
 
 
367 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  46.2 
 
 
355 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2692  alkanesulfonate monooxygenase  44.11 
 
 
362 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5872  alkanesulfonate monooxygenase  45.83 
 
 
364 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0969875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3933  alkanesulfonate monooxygenase  45.28 
 
 
364 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00336425  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4433  alkanesulfonate monooxygenase  45.28 
 
 
364 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911225  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5179  sulfonate monooxygenase  39.01 
 
 
367 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1529  alkanesulfonate monooxygenase  45.28 
 
 
364 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4325  alkanesulfonate monooxygenase  45 
 
 
371 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34620  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.38 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.654688  normal  0.605833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3764  Alkanesulfonate monooxygenase  42.62 
 
 
399 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3334  alkanesulfonate monooxygenase  41.32 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09191  conserved hypothetical protein  34.99 
 
 
361 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487585  normal  0.287472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4348  Alkanesulfonate monooxygenase  39.39 
 
 
379 aa  230  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4312  Alkanesulfonate monooxygenase  39.18 
 
 
404 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3757  alkanesulfonate monooxygenase  37.91 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507663  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03710  Alkanesulfonate monooxygenase  36.49 
 
 
332 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  34.23 
 
 
380 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  33.93 
 
 
380 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3916  luciferase-like  34.23 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  33.63 
 
 
381 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  35.71 
 
 
393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2847  alkanesulfonate monooxygenase, FMNH(2)- dependent  33.24 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00365376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3466  alkanesulfonate monooxygenase  33.93 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0467  Alkanesulfonate monooxygenase  35.21 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  32.55 
 
 
386 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3865  alkanesulfonate monooxygenase  42.41 
 
 
259 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  32.45 
 
 
382 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  34.22 
 
 
381 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 
382 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 
382 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  33.23 
 
 
382 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  32.64 
 
 
382 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2906  methanesulfonate sulfonatase MsuD  33.63 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  34.14 
 
 
388 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1777  alkanesulfonate monooxygenase  34.23 
 
 
394 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.300954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3247  alkanesulfonate monooxygenase  33.93 
 
 
379 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0369402  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4704  alkanesulfonate monooxygenase  31.98 
 
 
385 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2501  alkanesulfonate monooxygenase  32.85 
 
 
476 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3601  Alkanesulfonate monooxygenase  32.83 
 
 
395 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395254  normal  0.391492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  32.46 
 
 
382 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  32.64 
 
 
382 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  31.78 
 
 
387 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1324  alkanesulfonate monooxygenase  34.94 
 
 
360 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0455585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3717  Alkanesulfonate monooxygenase  32.83 
 
 
391 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  31.78 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  32.34 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3408  alkanesulfonate monooxygenase  32.83 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1502  alkanesulfonate monooxygenase  32.45 
 
 
364 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.670661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1997  alkanesulfonate monooxygenase  30.53 
 
 
371 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.618777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0115  alkanesulfonate monooxygenase oxidoreductase  33.52 
 
 
399 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0799771  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2493  alkanesulfonate monooxygenase  32.54 
 
 
386 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1377  alkanesulfonate monooxygenase  33.24 
 
 
378 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  31.5 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  32.44 
 
 
387 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  31.36 
 
 
381 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  31.86 
 
 
381 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2619  alkanesulfonate monooxygenase  31.82 
 
 
375 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106001  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1463  alkanesulfonate monooxygenase  31.36 
 
 
385 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 
382 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  32.94 
 
 
382 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  31.74 
 
 
382 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1484  alkanesulfonate monooxygenase  31.07 
 
 
385 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  31.2 
 
 
382 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1649  alkanesulfonate monooxygenase  31.75 
 
 
385 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  0.0602985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>