More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03500 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 287 aa  560  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  38.43 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  34.28 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.52 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  31.91 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.1 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.49 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.16 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.49 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35.66 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.24 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  35.52 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18580  universal stress protein UspA-like protein  31.62 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.68 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 297 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  34.59 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.9 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.25 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.62 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  31.74 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.19 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  31.72 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  31.12 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  31.44 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 294 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.36 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  37.93 
 
 		 143 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  32.31 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.84 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.6 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.6 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  35.82 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.6 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  42.55 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  40 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  32.53 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.03 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.35 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.91 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  30.33 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.89 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  32.95 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  32.77 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.1 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  41.38 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  32.47 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.76 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  30.24 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  32.99 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  31.67 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  33.07 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  32.86 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  33.45 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  31.07 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  31.01 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  36.05 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  33.33 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  29.31 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  32.41 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  37.58 
 
 		 144 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  33.68 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  31.12 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  33.99 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  32.13 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  31.19 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  30.19 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2049  UspA domain-containing protein  29.35 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>