40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2394 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  312  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 
137 aa  111  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.69 
 
 
132 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.97 
 
 
131 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  38.1 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.19 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0680  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00734165  normal  0.352119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  31.17 
 
 
167 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.26 
 
 
106 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 
134 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  29.87 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 
172 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.19 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  35.71 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  31.51 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  23.33 
 
 
171 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  35.71 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.32 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  31.15 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  25.93 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  31.58 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.65 
 
 
476 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.71 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  28.75 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  25 
 
 
162 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.18 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  27.87 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  24.1 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 
159 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  23.36 
 
 
119 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 
153 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>