87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1644 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 
138 aa  283  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  256  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  256  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  256  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  256  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  256  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  89.05 
 
 
137 aa  256  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  89.05 
 
 
137 aa  254  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  89.78 
 
 
137 aa  254  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  89.05 
 
 
137 aa  253  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  29.37 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  29.6 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  29.75 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  30.51 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  30.43 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  33.05 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  29.25 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  36.62 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  36.62 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  36.62 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  31.52 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  38.03 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  29.41 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  35.21 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  35.21 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  26.23 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  23.33 
 
 
205 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  23.89 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  29.81 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  24.81 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  36.62 
 
 
118 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  21.14 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  34.67 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  24.41 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  29.81 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2483  transcriptional repressor, CopY family  28.69 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.481913  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  32.73 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  23.33 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  32.73 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  32.73 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  31.82 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  31.13 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  26.83 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  28.72 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  30.99 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  31.82 
 
 
166 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 
139 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  28.89 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  28.23 
 
 
141 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  22.95 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  25.22 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  28.57 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  30.43 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  30.38 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  28.16 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  25.53 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  30.56 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  29.51 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  28.3 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  28.3 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  28.3 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  28.3 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  27.03 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  27.34 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  27.03 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  22.41 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  29.41 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  29.57 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  27.88 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  28.69 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  22.13 
 
 
142 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  27.78 
 
 
126 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  27.78 
 
 
126 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  28.38 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  26.96 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  28.1 
 
 
132 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  28.3 
 
 
138 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>