More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6964 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  100 
 
 		 363 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  99.72 
 
 		 363 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  55.22 
 
 		 365 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.12 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  55.94 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  55.12 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  55.53 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  55.53 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.64 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  55.65 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  55.12 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  55.12 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  55.12 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.12 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  54.86 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.12 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.12 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.12 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.12 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.12 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  53.03 
 
 		 371 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  52.83 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  52.91 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.16 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  53.7 
 
 		 371 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  52.13 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  54.16 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  51.32 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  51.59 
 
 		 371 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  52.7 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  53.19 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.75 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  52.3 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  52.3 
 
 		 386 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  52.3 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  52.03 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.5 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  51.63 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  50.54 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  51.76 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  51.08 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.62 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  53.57 
 
 		 365 aa  361  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  53.17 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  53.83 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  52.62 
 
 		 349 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  52.66 
 
 		 357 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  53.55 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  52.45 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  51.52 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  53.85 
 
 		 355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.53 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.93 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  54.22 
 
 		 360 aa  355  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  51.96 
 
 		 369 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  51.19 
 
 		 368 aa  355  7.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  51.52 
 
 		 352 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.23 
 
 		 369 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  51.92 
 
 		 355 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  49.47 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  51.68 
 
 		 369 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  50.96 
 
 		 355 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  51.39 
 
 		 357 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  54.35 
 
 		 353 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  53.57 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  51.25 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  51.4 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  51.66 
 
 		 368 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  52.34 
 
 		 351 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  51.66 
 
 		 368 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  50.54 
 
 		 380 aa  348  6e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  51.4 
 
 		 369 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  51.92 
 
 		 356 aa  348  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.47 
 
 		 367 aa  348  7e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.47 
 
 		 367 aa  348  7e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  53.68 
 
 		 354 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  52.19 
 
 		 353 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.73 
 
 		 365 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 369 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  53.17 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.13 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.02 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  52.34 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  48.53 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  51.77 
 
 		 353 aa  346  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  50.69 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.07 
 
 		 366 aa  345  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.14 
 
 		 372 aa  345  6e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.52 
 
 		 370 aa  345  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.75 
 
 		 360 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.33 
 
 		 367 aa  345  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  50.97 
 
 		 357 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.07 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.07 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.07 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.33 
 
 		 365 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>