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for query gene Bcen_4120 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  96.11 
 
 
411 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  85.71 
 
 
413 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
411 aa  804    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  82 
 
 
411 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  99.76 
 
 
411 aa  801    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  69.44 
 
 
403 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  69.44 
 
 
403 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  69.44 
 
 
403 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  69.44 
 
 
403 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  69.64 
 
 
395 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  68.94 
 
 
403 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  69.44 
 
 
403 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  72.01 
 
 
411 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.5 
 
 
394 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
498 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.96 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.76 
 
 
411 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.94 
 
 
424 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.94 
 
 
429 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.12 
 
 
392 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  33.6 
 
 
392 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  33.33 
 
 
392 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 
393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.38 
 
 
444 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.12 
 
 
399 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.48 
 
 
411 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.72 
 
 
393 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 
393 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.13 
 
 
412 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  31.99 
 
 
420 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.53 
 
 
398 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.67 
 
 
405 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.81 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.51 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.43 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  31.61 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0456  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.613972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.43 
 
 
393 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.53 
 
 
405 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.87 
 
 
434 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.87 
 
 
405 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.87 
 
 
405 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.29 
 
 
399 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.08 
 
 
416 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  31.89 
 
 
426 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32 
 
 
399 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.28 
 
 
406 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.78 
 
 
399 aa  159  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  35.59 
 
 
392 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.06 
 
 
458 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
405 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
405 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.15 
 
 
409 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.06 
 
 
430 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.41 
 
 
403 aa  155  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.31 
 
 
411 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.72 
 
 
409 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.08 
 
 
410 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.02 
 
 
409 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  33.15 
 
 
404 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.61 
 
 
414 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.41 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.31 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.64 
 
 
400 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 
403 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.74 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  35.56 
 
 
402 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.01 
 
 
403 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.66 
 
 
389 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.13 
 
 
401 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.77 
 
 
404 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.15 
 
 
391 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  30.15 
 
 
409 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.4 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.07 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.91 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.53 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.31 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.55 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.73 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5318  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.47 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  31.23 
 
 
407 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  34.44 
 
 
411 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.44 
 
 
411 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.45 
 
 
405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.19 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  29.49 
 
 
401 aa  146  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.15 
 
 
440 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.05 
 
 
424 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  31.18 
 
 
411 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.37 
 
 
400 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.37 
 
 
400 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.37 
 
 
400 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.37 
 
 
400 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.15 
 
 
424 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.59 
 
 
428 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 
399 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  25.26 
 
 
413 aa  144  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.9 
 
 
435 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal 
 
 
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