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for query gene Tpau_0456 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0456  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
409 aa  781    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.613972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.05 
 
 
413 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.11 
 
 
411 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.26 
 
 
411 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.26 
 
 
411 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.81 
 
 
403 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.97 
 
 
411 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.81 
 
 
403 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.81 
 
 
403 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  34.81 
 
 
403 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  35.11 
 
 
395 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.25 
 
 
403 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  34.25 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.09 
 
 
411 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 
405 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.28 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.85 
 
 
394 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.36 
 
 
398 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.53 
 
 
393 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.23 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.96 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.68 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.19 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  29.65 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.16 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3190  major facilitator transporter  27.71 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.19 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.88 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.88 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  29.4 
 
 
387 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.06 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.87 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.05 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  26.99 
 
 
399 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.12 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.79 
 
 
424 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.45 
 
 
461 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  34.52 
 
 
392 aa  109  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.32 
 
 
416 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  31.29 
 
 
426 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.5 
 
 
440 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.94 
 
 
409 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.64 
 
 
399 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.07 
 
 
411 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.95 
 
 
405 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 
411 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.16 
 
 
409 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.51 
 
 
414 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.4 
 
 
414 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.26 
 
 
465 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.74 
 
 
418 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 
458 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 
405 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.44 
 
 
412 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.63 
 
 
419 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.89 
 
 
416 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.89 
 
 
416 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 
405 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.89 
 
 
416 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.89 
 
 
416 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.9 
 
 
386 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.28 
 
 
407 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.92 
 
 
399 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.85 
 
 
405 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.96 
 
 
399 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  24.31 
 
 
409 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.69 
 
 
409 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.49 
 
 
416 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 
405 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  27 
 
 
404 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.32 
 
 
411 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.24 
 
 
416 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 
444 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  28.21 
 
 
410 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  28.21 
 
 
410 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.69 
 
 
413 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.25 
 
 
420 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.74 
 
 
405 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  27.82 
 
 
410 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  29.41 
 
 
402 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.49 
 
 
416 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3306  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.63 
 
 
404 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  31.18 
 
 
411 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.53 
 
 
391 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  28.21 
 
 
410 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.58 
 
 
425 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.18 
 
 
400 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.18 
 
 
400 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.18 
 
 
411 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.18 
 
 
400 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.58 
 
 
398 aa  100  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.18 
 
 
411 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.18 
 
 
400 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  26.58 
 
 
398 aa  100  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3135  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.58 
 
 
415 aa  99.8  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.23 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.84 
 
 
419 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.14 
 
 
418 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
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