More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4102 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  95.98 
 
 
423 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  91.02 
 
 
423 aa  807    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  100 
 
 
423 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  96.45 
 
 
423 aa  844    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  100 
 
 
423 aa  868    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  96.22 
 
 
423 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  100 
 
 
423 aa  868    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  63.35 
 
 
425 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  63.35 
 
 
425 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  62.74 
 
 
424 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  53.28 
 
 
418 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  52.67 
 
 
444 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  52.67 
 
 
444 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  52.67 
 
 
444 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  49.28 
 
 
418 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  49.88 
 
 
421 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  50.25 
 
 
421 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  49.64 
 
 
421 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  49.28 
 
 
417 aa  421  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  49.39 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  49.39 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  49.39 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  49.39 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  49.75 
 
 
412 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  49.39 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  49.02 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  49.75 
 
 
412 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  48.29 
 
 
442 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  49.15 
 
 
451 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  47.2 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  42.07 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  35.61 
 
 
412 aa  300  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  34.16 
 
 
399 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  34.16 
 
 
399 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  37.96 
 
 
422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 
429 aa  253  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  31.43 
 
 
442 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
443 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
752 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  33.58 
 
 
872 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  33.85 
 
 
927 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  33.85 
 
 
1115 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.85 
 
 
1115 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.46 
 
 
1119 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
1124 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.06 
 
 
1099 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.45 
 
 
1115 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 
789 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 
789 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 
789 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
428 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
637 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.07 
 
 
1115 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 
1101 aa  136  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
1002 aa  136  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.53 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.75 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 
1120 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 
1154 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
495 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
464 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
1118 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
549 aa  116  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30.43 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
479 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
395 aa  113  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
479 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
479 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
445 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
445 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
509 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
509 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
450 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
509 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.06 
 
 
422 aa  108  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
464 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
393 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 
470 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
420 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  29.93 
 
 
520 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.93 
 
 
505 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  29.93 
 
 
662 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.93 
 
 
633 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
450 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
501 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  24.69 
 
 
452 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
501 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
469 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
501 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
446 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
494 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
520 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
485 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>