62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3417 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  100 
 
 		 313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  96.17 
 
 		 313 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  87.18 
 
 		 313 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  84.62 
 
 		 313 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  84.92 
 
 		 306 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  70.61 
 
 		 313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  67.41 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  67.41 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  67.83 
 
 		 315 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  67.73 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  59.74 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  55.91 
 
 		 314 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  55.91 
 
 		 314 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  35.69 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  35.05 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  35.05 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  34.41 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  35.05 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  34.73 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  34.73 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  32.45 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  35.39 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  35.39 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  35.39 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  35.39 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  35.39 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  35.39 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  35.39 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  33.44 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  27.24 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  32.65 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  33.54 
 
 		 578 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  33.86 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  30.92 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  30.92 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  33.87 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  29.52 
 
 		 400 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  31.53 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  31.84 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  31.34 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  28.1 
 
 		 718 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  21.69 
 
 		 544 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  21.69 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  34.51 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.13 
 
 		 560 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 565 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  21.16 
 
 		 547 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  21.69 
 
 		 544 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  29.46 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  29.87 
 
 		 663 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  21.69 
 
 		 544 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.46 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  23.28 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  31.13 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  28.97 
 
 		 718 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.14 
 
 		 564 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 571 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  21.69 
 
 		 547 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  33.86 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  21.16 
 
 		 544 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>