More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3495 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 322 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  77.02 
 
 		 326 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5175  UDP-galactose 4-epimerase  71.52 
 
 		 329 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  71.2 
 
 		 329 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  71.2 
 
 		 329 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  68.35 
 
 		 325 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  69.45 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  66.35 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 319 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  52.37 
 
 		 325 aa  298  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  47.95 
 
 		 323 aa  279  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  47.84 
 
 		 332 aa  268  8e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  48.11 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  44.62 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  43.17 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  41.9 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  41.9 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  43.48 
 
 		 328 aa  251  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  41.88 
 
 		 324 aa  251  9.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  45.06 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  40.51 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  42.32 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  39.25 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  43.52 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  42.01 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  43.35 
 
 		 328 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  44.03 
 
 		 328 aa  245  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  41.41 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  42.95 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  42.95 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  43.89 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  42.32 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  41.43 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  47.63 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 		 327 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  43.4 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  40.31 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  43.81 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  40.69 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  40.48 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  40.76 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  37.42 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  43.77 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  40.81 
 
 		 332 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  38.75 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  36.08 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  43.08 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  41.82 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  40.37 
 
 		 341 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  39.45 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  45.39 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  45.18 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  42.72 
 
 		 329 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  40.81 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  39.94 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  40.84 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  43.17 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  42.19 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  45.07 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  40.24 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  43.75 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  41.28 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  42.19 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  43.21 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  43.48 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  39.64 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  40.24 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  41.28 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  43.52 
 
 		 351 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  38.8 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  43.83 
 
 		 331 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  44 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  39.18 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  39.45 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  41.46 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  40.31 
 
 		 332 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  42.55 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  41.56 
 
 		 327 aa  229  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  38.68 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  41.98 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 		 330 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  38.32 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>