More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0441 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2951  DNA gyrase subunit A  41.99 
 
 		 866 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  40.02 
 
 		 836 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  43.12 
 
 		 809 aa  674    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  41.85 
 
 		 857 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 		 923 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  41.08 
 
 		 859 aa  636    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  46.42 
 
 		 815 aa  754    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  41.77 
 
 		 893 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  42.98 
 
 		 860 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  41.62 
 
 		 885 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  43.1 
 
 		 823 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  43.95 
 
 		 832 aa  693    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  42.05 
 
 		 819 aa  655    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2411  DNA gyrase, A subunit  40.45 
 
 		 919 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1745  DNA gyrase, subunit A  39.52 
 
 		 928 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.6885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  43.1 
 
 		 823 aa  699    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  43.1 
 
 		 823 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  43.3 
 
 		 823 aa  700    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  41.87 
 
 		 866 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  41.31 
 
 		 863 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  41.31 
 
 		 863 aa  667    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3647  DNA gyrase subunit A  39.75 
 
 		 925 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  39.23 
 
 		 922 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1230  DNA gyrase subunit A  41.62 
 
 		 879 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0017603  normal  0.486018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  43.65 
 
 		 823 aa  689    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0195  DNA gyrase subunit A  41.87 
 
 		 866 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  41.29 
 
 		 883 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  44.97 
 
 		 949 aa  690    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  42.36 
 
 		 849 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  41.99 
 
 		 866 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0171  DNA gyrase, subunit A  40.97 
 
 		 846 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4078  DNA gyrase subunit A  41.45 
 
 		 887 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0373422  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  44.01 
 
 		 835 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4153  DNA gyrase subunit A  41.76 
 
 		 867 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  42.89 
 
 		 815 aa  656    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  42.2 
 
 		 828 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  41.87 
 
 		 857 aa  673    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  42.71 
 
 		 811 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  43.07 
 
 		 871 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  43.1 
 
 		 823 aa  699    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  43.76 
 
 		 827 aa  698    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  39.83 
 
 		 856 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  40.72 
 
 		 893 aa  665    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0953  DNA gyrase subunit A  41.87 
 
 		 866 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.665662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  41.24 
 
 		 814 aa  672    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1632  DNA gyrase subunit A  42.23 
 
 		 866 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  44.01 
 
 		 824 aa  680    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  41.32 
 
 		 834 aa  638    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  40.35 
 
 		 839 aa  649    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  41.76 
 
 		 889 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  41.85 
 
 		 839 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  41.16 
 
 		 864 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  40.94 
 
 		 880 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  42.11 
 
 		 882 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1948  DNA gyrase, A subunit  40.8 
 
 		 908 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000559672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  44.47 
 
 		 830 aa  714    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  40.73 
 
 		 907 aa  670    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2070  DNA gyrase, A subunit  40.33 
 
 		 917 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122106  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0713  DNA gyrase subunit A  42.06 
 
 		 897 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  42.55 
 
 		 811 aa  681    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  40.41 
 
 		 865 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0561  DNA gyrase subunit A  41.76 
 
 		 867 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  41.55 
 
 		 852 aa  663    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  42.46 
 
 		 879 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  41.64 
 
 		 865 aa  676    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  46.02 
 
 		 839 aa  727    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  46.14 
 
 		 839 aa  730    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2062  DNA gyrase, A subunit  40.21 
 
 		 916 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000488148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1919  DNA gyrase subunit A  40.68 
 
 		 946 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000233211  hitchhiker  0.00000000296006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2059  DNA gyrase subunit A  40.68 
 
 		 944 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00127013  unclonable  0.0000452472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  40.77 
 
 		 862 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3947  DNA gyrase subunit A  39.39 
 
 		 919 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00094025  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  41.9 
 
 		 812 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  41.52 
 
 		 867 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23260  DNA gyrase subunit A  38.98 
 
 		 921 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  43.07 
 
 		 836 aa  673    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  41.75 
 
 		 866 aa  642    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  41.59 
 
 		 829 aa  666    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  41.9 
 
 		 848 aa  663    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  42.84 
 
 		 817 aa  676    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  42.87 
 
 		 809 aa  669    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1040  DNA gyrase subunit A  41.76 
 
 		 867 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  44.46 
 
 		 796 aa  687    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  41.42 
 
 		 813 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1949  DNA gyrase, A subunit  42.03 
 
 		 879 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0708311  hitchhiker  0.00786865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1972  DNA gyrase subunit A  40.68 
 
 		 918 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000455042  hitchhiker  0.000000817353 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  40.43 
 
 		 894 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  43.06 
 
 		 856 aa  687    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  41.7 
 
 		 843 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  41.95 
 
 		 827 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  42.38 
 
 		 834 aa  667    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2888  DNA gyrase subunit A  41.99 
 
 		 866 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  41.52 
 
 		 856 aa  688    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  40.87 
 
 		 856 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3280  DNA gyrase subunit A  39.84 
 
 		 886 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.586239  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2790  DNA gyrase subunit A  40.35 
 
 		 889 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0140578  hitchhiker  0.00260367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2464  DNA gyrase subunit A  40.82 
 
 		 888 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413363 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2578  DNA gyrase subunit A  41.87 
 
 		 888 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  46.01 
 
 		 818 aa  739    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2238  DNA gyrase subunit A  41.13 
 
 		 873 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>