More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5324 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 473 aa  938    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  94.71 
 
 		 473 aa  889    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.547854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.71 
 
 		 469 aa  869    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248447  normal  0.139653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.31 
 
 		 473 aa  921    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739946  normal  0.0152706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3932  histidine kinase  94.7 
 
 		 474 aa  895    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3588  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  95.47 
 
 		 474 aa  885    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6694  putative two-component system histidine kinase  45.81 
 
 		 462 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  42.3 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 462 aa  292  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0287  two-component system, sensor protein  32.02 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0258  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.818246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4162  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4431  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 462 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3492  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02406  two-component system sensor protein  33.79 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 464 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  31.72 
 
 		 474 aa  187  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 476 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 459 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 459 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 459 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 524 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  32.88 
 
 		 496 aa  169  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.46 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 531 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  31.74 
 
 		 526 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 462 aa  166  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  32.66 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2927  tricarboxylic transport: regulatory protein  32.48 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2980  tricarboxylic transport regulatory protein  32.48 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.675571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2963  tricarboxylic transport: regulatory protein  32.48 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2896  tricarboxylic transport: regulatory protein  32.48 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.26 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3083  tricarboxylic transporter regulatory protein  32.25 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  30.61 
 
 		 460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 505 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 505 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  31.02 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  31.41 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  32.29 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 505 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  31.32 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  32.79 
 
 		 440 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.19 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 517 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 515 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  31.09 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  32.74 
 
 		 817 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  30.4 
 
 		 499 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  32.29 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 505 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  31.29 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3125  sensor protein QseC  30.67 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 515 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 460 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 474 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 474 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  31.4 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  31.53 
 
 		 517 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  31.69 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 459 aa  156  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  31.79 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  32.87 
 
 		 464 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  30.4 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  32.2 
 
 		 460 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  30.79 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  30.63 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  30.58 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  30.63 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  30.14 
 
 		 472 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  32.64 
 
 		 504 aa  150  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  29.36 
 
 		 500 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  31.79 
 
 		 463 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  30.5 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3333  histidine kinase  31.64 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  32.19 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>