More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2896 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2896  tricarboxylic transport: regulatory protein  100 
 
 
471 aa  953    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2927  tricarboxylic transport: regulatory protein  99.79 
 
 
471 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2963  tricarboxylic transport: regulatory protein  100 
 
 
471 aa  953    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3083  tricarboxylic transporter regulatory protein  99.79 
 
 
471 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2980  tricarboxylic transport regulatory protein  100 
 
 
471 aa  953    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.675571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.13 
 
 
472 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  59.23 
 
 
463 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  57.36 
 
 
466 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  38.04 
 
 
474 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
459 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
459 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
463 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  37.27 
 
 
460 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  39.64 
 
 
460 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
461 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.59 
 
 
475 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  37.53 
 
 
460 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
459 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
465 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  39.38 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  36.14 
 
 
489 aa  234  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2074  histidine kinase  38.15 
 
 
467 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.157607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
485 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
476 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  33.78 
 
 
472 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  36.04 
 
 
495 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  34.76 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
463 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  32.88 
 
 
472 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  33.03 
 
 
474 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
477 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
463 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  34.08 
 
 
439 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  33.72 
 
 
496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  32.83 
 
 
499 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  34.05 
 
 
501 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  34.05 
 
 
501 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  34.05 
 
 
501 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  34.05 
 
 
501 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  34.05 
 
 
501 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
501 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
515 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
501 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
478 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
462 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
515 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
517 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
481 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  32.89 
 
 
517 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.05 
 
 
515 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
515 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  32.74 
 
 
817 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  32.74 
 
 
523 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  32.96 
 
 
518 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
515 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
487 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
462 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  33.26 
 
 
473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  32.57 
 
 
500 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
531 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
509 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  36.75 
 
 
508 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  32.22 
 
 
505 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  32.22 
 
 
505 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  32.22 
 
 
505 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
473 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.547854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.51 
 
 
513 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  32 
 
 
505 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  31.54 
 
 
517 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
517 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
517 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3588  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
474 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  32.13 
 
 
526 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
482 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
493 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  32.67 
 
 
481 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
517 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3932  histidine kinase  31.4 
 
 
474 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739946  normal  0.0152706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  34.01 
 
 
471 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.9 
 
 
509 aa  189  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
469 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248447  normal  0.139653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  32.14 
 
 
461 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  33.12 
 
 
500 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  31.68 
 
 
467 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  31.04 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
464 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4162  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
476 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  32.33 
 
 
460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  33.05 
 
 
473 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
485 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>