More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3125 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3125  sensor protein QseC  100 
 
 
457 aa  905    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.3 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3492  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
456 aa  358  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0651449 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0258  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.818246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02406  two-component system sensor protein  36.03 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  33.54 
 
 
474 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0287  two-component system, sensor protein  33.92 
 
 
457 aa  212  9e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
463 aa  209  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  31.6 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4162  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  34.48 
 
 
461 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
459 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
463 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
459 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4431  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
462 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
464 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
463 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
463 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
461 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  31.76 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  30.3 
 
 
474 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
478 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  33.72 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  30.07 
 
 
460 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  30.07 
 
 
460 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
476 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  31.31 
 
 
460 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6694  putative two-component system histidine kinase  30.4 
 
 
462 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  32.07 
 
 
467 aa  172  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
473 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.739946  normal  0.0152706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
524 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
460 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  31.68 
 
 
499 aa  170  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3932  histidine kinase  30.89 
 
 
474 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
473 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3588  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
474 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301735  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  30.59 
 
 
472 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  29.21 
 
 
500 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  32.39 
 
 
495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
469 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  33.56 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
473 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.547854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
472 aa  166  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
494 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
469 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248447  normal  0.139653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  31.81 
 
 
494 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
493 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  31.22 
 
 
467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  32.24 
 
 
494 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
515 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  32.24 
 
 
494 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  32.24 
 
 
488 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  32.24 
 
 
488 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  32.24 
 
 
488 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
494 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  32.24 
 
 
488 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
494 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
494 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.65 
 
 
513 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  27.86 
 
 
501 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  29.3 
 
 
439 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  29.47 
 
 
504 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
487 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
531 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
494 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  30.6 
 
 
526 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3340  sensor histidine kinase  31.52 
 
 
495 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
462 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  30.05 
 
 
471 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
501 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
501 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  29.48 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  29.48 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  29.48 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  29.48 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  29.48 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0007  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
500 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  30.41 
 
 
817 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
462 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  30.07 
 
 
523 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.18 
 
 
475 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  30.75 
 
 
518 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  30.63 
 
 
505 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2074  histidine kinase  29.35 
 
 
467 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.157607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
462 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
517 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  29.93 
 
 
517 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  29.64 
 
 
517 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
517 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>