More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3686 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  99.58 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  96.2 
 
 		 237 aa  460  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  96.2 
 
 		 237 aa  460  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  96.2 
 
 		 237 aa  460  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  91.56 
 
 		 237 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  63.4 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  61.18 
 
 		 238 aa  291  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  60.76 
 
 		 238 aa  289  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  61.23 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3144  riboflavin synthase subunit alpha  57.52 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  58.85 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  55.95 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  46.7 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  47.47 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  47.47 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  44.97 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 204 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  40.78 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  38.76 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  38.76 
 
 		 209 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 209 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 		 204 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 204 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 203 aa  141  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  41.58 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  40.11 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 203 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 203 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  38.65 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 204 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  34.95 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  37.57 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  37.56 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  33.48 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  39.79 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  38.79 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  40.74 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  36.76 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  40.64 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  34.84 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  35.83 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  38.5 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  37.43 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 196 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>