More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3232 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3232  ABC transporter related  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5261  ABC transporter related  92.83 
 
 		 279 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4838  ABC transporter related  59.2 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322693  normal  0.0389371 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6258  ABC transporter related  58.23 
 
 		 257 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000084841  normal  0.418068 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4584  ABC transporter related  58.17 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  50.19 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  49.62 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.62 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  52.23 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  51.63 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  48.66 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  51.01 
 
 		 254 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  51.65 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  48.66 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.03 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.61 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  50 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  52.03 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  52.03 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  50.39 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  50.99 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  51.63 
 
 		 241 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 		 244 aa  242  6e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  50.4 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  51.22 
 
 		 240 aa  241  9e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  50.4 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  50 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  50.38 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  50.2 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  51.01 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 242 aa  238  6.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 		 240 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  50.6 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  50.19 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.59 
 
 		 240 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  48.59 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  51.01 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  51 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  48.65 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  50.4 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  49.19 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  49.04 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  47.98 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  49.8 
 
 		 252 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  50.19 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  50.19 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  47.89 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 241 aa  234  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  51.45 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  48.09 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  48.05 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  48.02 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  48.02 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  49.19 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  50.81 
 
 		 240 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  49.21 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  48.02 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  49.62 
 
 		 258 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  47.39 
 
 		 269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  49 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.99 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  48.05 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  49.8 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  48.44 
 
 		 251 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  48.39 
 
 		 246 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  50 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  48.43 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  47.97 
 
 		 246 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  47.37 
 
 		 247 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  44.53 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  49.41 
 
 		 258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  49.39 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  47.27 
 
 		 257 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>