More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0377 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  99.64 
 
 
277 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  98.56 
 
 
390 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  78.7 
 
 
277 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  60.89 
 
 
275 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  58.21 
 
 
279 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  57.25 
 
 
285 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  54.87 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  53.87 
 
 
286 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  56.92 
 
 
265 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  55.88 
 
 
280 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  54.23 
 
 
270 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  54.23 
 
 
270 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  53.12 
 
 
275 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  56.13 
 
 
265 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  56.13 
 
 
265 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  53.52 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  51.81 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  39.39 
 
 
266 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
257 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
271 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  37.82 
 
 
276 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 
255 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 
284 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  35.34 
 
 
277 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  35.27 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
272 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
284 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  35.29 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  33.76 
 
 
270 aa  128  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  33.06 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
271 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  32.33 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 
273 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  31.36 
 
 
267 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  33.2 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  32.41 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.72 
 
 
374 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
339 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  25.23 
 
 
290 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
250 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 
340 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  22.44 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
290 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  24.56 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.67 
 
 
370 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  23.27 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  27.44 
 
 
393 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  31.14 
 
 
345 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.08 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 
259 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 
299 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.91 
 
 
370 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 
299 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  23.67 
 
 
291 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
344 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.91 
 
 
370 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  22.67 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 
387 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  24.08 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  25.1 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  23.27 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.08 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  23.27 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  26.09 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
335 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  23.17 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  22.75 
 
 
333 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  27.99 
 
 
397 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  20.82 
 
 
298 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  26.2 
 
 
296 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  29.77 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>