72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_0857 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_0857  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 
113 aa  234  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0432305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0845  transcriptional regulator  98.23 
 
 
113 aa  229  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0891  PadR family transcriptional regulator  98.23 
 
 
113 aa  228  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0947  PadR family transcriptional regulator  98.23 
 
 
113 aa  228  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1118  transcriptional regulator, PadR family  97.35 
 
 
113 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1031  transcriptional regulator, PadR family  94.69 
 
 
113 aa  221  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97206e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0849  PadR-like family transcriptional regulator  92.92 
 
 
113 aa  216  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  47.06 
 
 
117 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
111 aa  97.1  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  40.21 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  31.13 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1722  PadR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0258  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.630662  normal  0.0600002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3915  PadR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.507829  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  29.81 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  29.9 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0677  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.744991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  26.04 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  29.36 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  29.79 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  27.91 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  29.59 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  29.59 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  29.59 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  28 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  29.59 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 
108 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
150 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  32.99 
 
 
117 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  33.78 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  30.67 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  27.36 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  31.13 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  29.17 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  29.17 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  29.17 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  29.17 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  29.17 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  29.17 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  29.17 
 
 
150 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>