30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0677 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0677  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.744991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0258  transcriptional regulator, PadR-like family  64.71 
 
 		 127 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.630662  normal  0.0600002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1722  PadR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 115 aa  154  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3915  PadR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 120 aa  146  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.507829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1923  Pex protein  43.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.189528  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0406  PadR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371791  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0891  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  30.49 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0947  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0845  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0857  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0432305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1118  transcriptional regulator, PadR family  31.08 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1031  transcriptional regulator, PadR family  31.08 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97206e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0849  PadR-like family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 114 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 125 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  26.04 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  31.76 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  31.76 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>