More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1212 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1447  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  100 
 
 		 434 aa  857    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2464  putative D-amino acid dehydrogenase small subunit  99.54 
 
 		 506 aa  854    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1938  D-amino-acid dehydrogenase  73.96 
 
 		 433 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5216  D-amino-acid dehydrogenase  73.5 
 
 		 433 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2134  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  95.85 
 
 		 434 aa  799    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0270937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2305  D-amino-acid dehydrogenase  99.77 
 
 		 434 aa  855    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3366  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  100 
 
 		 434 aa  857    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2344  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  99.77 
 
 		 434 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6164  D-amino-acid dehydrogenase  74.19 
 
 		 433 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1212  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  100 
 
 		 434 aa  857    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1833  D-amino-acid dehydrogenase  75.58 
 
 		 434 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1903  D-amino-acid dehydrogenase  75.12 
 
 		 434 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.612686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1939  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  100 
 
 		 434 aa  857    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1915  D-amino-acid dehydrogenase  74.19 
 
 		 433 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1359  D-amino-acid dehydrogenase  75.58 
 
 		 434 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385904  normal  0.690046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2285  D-amino-acid dehydrogenase  66.05 
 
 		 432 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1916  D-amino-acid dehydrogenase  63.97 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1021  D-amino-acid dehydrogenase  63.05 
 
 		 433 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1981  D-amino-acid dehydrogenase  34.74 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0772437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1877  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000325686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  30.37 
 
 		 424 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0309  D-amino-acid dehydrogenase  31.66 
 
 		 430 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2597  D-amino-acid dehydrogenase  31.5 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  29.98 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2701  D-amino-acid dehydrogenase  30.16 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0406  D-amino-acid dehydrogenase  30.16 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0385  D-amino-acid dehydrogenase  30.93 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.94 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3504  D-amino-acid dehydrogenase  30.49 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1987  D-amino-acid dehydrogenase  33.01 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312854  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.02 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.64 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  30.45 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.41 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2587  D-amino-acid dehydrogenase  33.56 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  33.88 
 
 		 415 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2697  D-amino-acid dehydrogenase  30.44 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402587  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  30.79 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1221  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  28.15 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.26 
 
 		 416 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.4 
 
 		 416 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.4 
 
 		 416 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 418 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1756  D-amino-acid dehydrogenase  30.09 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.141509 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.51 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.75 
 
 		 433 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.41 
 
 		 416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1822  D-amino-acid dehydrogenase  33.56 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.23 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.29 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.29 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.29 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  27.66 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.65 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.64 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.64 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.64 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.64 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.64 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.64 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.64 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.44 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.64 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.99 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  27.99 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.99 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.99 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.99 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.99 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.44 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.5 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  27.99 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.99 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.43 
 
 		 433 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1347  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.99 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.15982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.21 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.19 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.41 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.19 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.86 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.95 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.96 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.34 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  28.94 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  27.95 
 
 		 439 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  26.11 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  27.17 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.41 
 
 		 434 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.08 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2852  D-amino-acid dehydrogenase  31.13 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.196482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.18 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.18 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.94 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.86 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.33 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.18 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>