More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1234 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 279 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  99.59 
 
 		 246 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  99.59 
 
 		 246 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  99.59 
 
 		 246 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  99.59 
 
 		 246 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  99.19 
 
 		 246 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  86.22 
 
 		 311 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  72.4 
 
 		 254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  72.4 
 
 		 254 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  71.6 
 
 		 254 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  73.41 
 
 		 254 aa  347  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  73.2 
 
 		 253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  72.8 
 
 		 253 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  72.8 
 
 		 253 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  65.84 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  68.25 
 
 		 252 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  67.86 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  57.09 
 
 		 246 aa  244  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 249 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 258 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 249 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  38.99 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  35.32 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  28.57 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.7 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  28.39 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  28.45 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  28.88 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.44 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  29.06 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1991  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.276035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.05 
 
 		 705 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  28.81 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  27.08 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  36.52 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.28 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.28 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  29.64 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.69 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  27.13 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.82 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  34.42 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.44 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  26.41 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>