43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1816 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  100 
 
 		 668 aa  1354    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  30.82 
 
 		 747 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  28.77 
 
 		 776 aa  296  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  29.67 
 
 		 908 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  29.94 
 
 		 836 aa  274  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.44 
 
 		 1043 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.63 
 
 		 815 aa  253  9.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.76 
 
 		 608 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.77 
 
 		 611 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  24.67 
 
 		 621 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.43 
 
 		 657 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  23.81 
 
 		 893 aa  106  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.66 
 
 		 631 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.17 
 
 		 595 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.3 
 
 		 629 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.99 
 
 		 629 aa  91.3  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  26.04 
 
 		 569 aa  90.9  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  23.53 
 
 		 616 aa  90.9  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  27.92 
 
 		 711 aa  88.2  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.46 
 
 		 630 aa  84  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.54 
 
 		 616 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  28.64 
 
 		 618 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.81 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  21.19 
 
 		 696 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  23.39 
 
 		 1085 aa  73.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  23.54 
 
 		 699 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  23.54 
 
 		 699 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.11 
 
 		 868 aa  72  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  22.33 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  20.15 
 
 		 955 aa  66.6  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  21.9 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  21.94 
 
 		 818 aa  65.9  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.47 
 
 		 659 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.24 
 
 		 609 aa  57.4  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  23.47 
 
 		 610 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0163  hypothetical protein  24.74 
 
 		 323 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427999  hitchhiker  1.86977e-20 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  27.78 
 
 		 610 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0008  hypothetical protein  24.38 
 
 		 644 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263896  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  25.5 
 
 		 847 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.7 
 
 		 811 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  21.27 
 
 		 945 aa  46.6  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  23.37 
 
 		 809 aa  47  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0008  ATPase  23.53 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>