35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1330 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  100 
 
 		 545 aa  1082    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  27.78 
 
 		 416 aa  131  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  26.53 
 
 		 428 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  29.23 
 
 		 353 aa  93.6  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  29.61 
 
 		 210 aa  86.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 438 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  24.05 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  24 
 
 		 415 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 426 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  32 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 		 459 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  47.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.87 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.87 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.82 
 
 		 460 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.24 
 
 		 469 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  28.36 
 
 		 443 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.78 
 
 		 478 aa  43.5  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>