67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1089 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 		 338 aa  694    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  34.57 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  28.8 
 
 		 316 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  30.42 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  30.1 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  29.22 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  29.28 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  26.82 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  27.48 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  26.82 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  29.64 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  27.15 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  26.49 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  26.45 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  26.45 
 
 		 321 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  26.45 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  26.45 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  26.45 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  26.45 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  25.81 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  25.5 
 
 		 325 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  26.13 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  28.74 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  25 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  23.1 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  20.39 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  21.22 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  24.02 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  19.54 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  21.88 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  22.02 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  25.31 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  24.56 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  25.35 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  37.5 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  24.83 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  23.12 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  23.62 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  35.71 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  24.61 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  24.61 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  24.18 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  34.94 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  24.52 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  22.12 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  33.73 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  29.2 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.57 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  24.38 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  21.51 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  34.29 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  24.14 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  24.76 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  23.75 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  22.3 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  24.32 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  24.24 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  32.18 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  22.56 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  22.56 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  22.56 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6055  PfkB domain protein  30.08 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  22.56 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  32.5 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  20.47 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>