More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0915 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0915  oligopeptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
261 aa  523  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1055  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.94 
 
 
560 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.573369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.58 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  44.27 
 
 
544 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  42.29 
 
 
271 aa  191  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  42.15 
 
 
282 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  44.3 
 
 
588 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  38.26 
 
 
686 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  41.87 
 
 
285 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  42.47 
 
 
536 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  39.39 
 
 
541 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 
539 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
282 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
292 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
276 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  39.52 
 
 
546 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  41.46 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2290  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.52 
 
 
342 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0795951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  40.97 
 
 
617 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01221  oligopeptide transporter subunit  39.83 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0178739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2401  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00548391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1733  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  39.83 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.018169  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.74 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01231  hypothetical protein  39.83 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1893  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  39.83 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.854707  normal  0.049175 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1395  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  39.83 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0589219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1989  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  38.17 
 
 
686 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  43.86 
 
 
540 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  42.48 
 
 
569 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1356  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  39.83 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  41.48 
 
 
328 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  37.21 
 
 
564 aa  179  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  44.74 
 
 
539 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  40.45 
 
 
593 aa  178  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1416  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  39.83 
 
 
334 aa  178  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.646079  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1933  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppF  39.39 
 
 
334 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0322405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1403  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  39.39 
 
 
334 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1950  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 
334 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1870  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppF  39.39 
 
 
334 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332373  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.2 
 
 
338 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1876  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppF  39.39 
 
 
334 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.650916  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2191  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 
334 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  37.7 
 
 
578 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2381  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 
334 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.643182  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.57 
 
 
332 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.36 
 
 
347 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1585  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppF  39.39 
 
 
334 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  43.35 
 
 
250 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  41.02 
 
 
627 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 
323 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0119  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 
339 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0814918  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  38.13 
 
 
554 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  41.05 
 
 
328 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  38.64 
 
 
542 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  43.62 
 
 
555 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4734  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 
339 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5322  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.24 
 
 
339 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4448  ABC transporter related  38.37 
 
 
287 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338055  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0463  ABC transporter related  42.74 
 
 
249 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724781  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5538  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 
339 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00809075  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.61 
 
 
341 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.570854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  40.87 
 
 
569 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6652  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
355 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4501  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 
332 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.229817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3054  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.16 
 
 
328 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1954  ABC transporter related  39.3 
 
 
283 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212998  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3267  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
339 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231305  normal  0.0278452 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40 
 
 
294 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  44.1 
 
 
539 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1825  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.09 
 
 
339 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 
539 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.5 
 
 
616 aa  175  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  41.74 
 
 
592 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.36 
 
 
333 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0753  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, ATPase subunit  42.61 
 
 
348 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2780  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 
324 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.368156  normal  0.0709961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  39.92 
 
 
566 aa  174  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2159  oligopeptide transport ATP-binding protein  38.1 
 
 
333 aa  174  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00546678  normal  0.0666705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2066  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 
333 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1956  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  38.1 
 
 
333 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.277866  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5409  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 
340 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.61 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6444  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.61 
 
 
330 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.247483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.69 
 
 
324 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24230  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.92 
 
 
597 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.98 
 
 
320 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2215  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.687809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  41.27 
 
 
562 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  40.61 
 
 
547 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  38.78 
 
 
611 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  39 
 
 
583 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  43.67 
 
 
539 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 
536 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.92 
 
 
564 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.49 
 
 
629 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  37.55 
 
 
530 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  38.93 
 
 
611 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>