64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0756 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0756  putative amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  41.94 
 
 		 230 aa  52.8  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  37.66 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  40.26 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  32.91 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  32.91 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  38.96 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  38.96 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  40.98 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1490  amidophosphoribosyltransferases-like protein  34.15 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000000336577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  34.88 
 
 		 248 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 		 279 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  23.38 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  31.65 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  42.31 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.07 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  34.12 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  43.1 
 
 		 299 aa  42  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 190 aa  42  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  34.12 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1753  orotate phosphoribosyltransferase  40.43 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 239 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  33.33 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  33.33 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  36.14 
 
 		 247 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 		 220 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  31.65 
 
 		 234 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  55.26 
 
 		 189 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 		 220 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  33.33 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 247 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 		 195 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  52.63 
 
 		 251 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  27.36 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2568  ComF family protein  36.99 
 
 		 245 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.23 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  37.88 
 
 		 272 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  37.14 
 
 		 262 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  35.59 
 
 		 243 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  44 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34.38 
 
 		 243 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  38.33 
 
 		 213 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>